48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0677 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  79.82 
 
 		 565 aa  941    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 565 aa  1139    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  78.76 
 
 		 565 aa  955    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  76.06 
 
 		 565 aa  892    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  49.35 
 
 		 567 aa  491  1e-137  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  42.31 
 
 		 575 aa  442  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  42.09 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 553 aa  420  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  39.93 
 
 		 625 aa  411  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  43.88 
 
 		 547 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  40.82 
 
 		 532 aa  400  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  43.94 
 
 		 550 aa  402  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  42.83 
 
 		 557 aa  398  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  43.3 
 
 		 551 aa  396  1e-109  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  39.33 
 
 		 575 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  39.65 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  37.97 
 
 		 590 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  38.94 
 
 		 595 aa  395  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  42.8 
 
 		 510 aa  392  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  43 
 
 		 510 aa  389  1e-107  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 		 509 aa  386  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  40.04 
 
 		 542 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  39.39 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  38.45 
 
 		 551 aa  375  1e-103  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 		 551 aa  373  1e-102  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 		 517 aa  372  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 556 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 		 515 aa  312  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  35.26 
 
 		 535 aa  295  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  24.72 
 
 		 398 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  21.62 
 
 		 393 aa  51.2  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  25.32 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 405 aa  50.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0256  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.52 
 
 		 430 aa  48.9  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 397 aa  48.9  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0258  conserved hypothetical protein, radical SAM domain family (UPF0004 domain protein)  21.67 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  23.8 
 
 		 393 aa  47.8  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  22.45 
 
 		 436 aa  47  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 398 aa  46.2  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2008  hypothetical protein  26.6 
 
 		 817 aa  45.4  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0530056  normal  0.455739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  22.95 
 
 		 599 aa  45.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1361  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.2 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1046  Radical SAM domain protein  26.97 
 
 		 490 aa  44.3  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2609  putative tRNA modifying protein  25.63 
 
 		 467 aa  43.5  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>