88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1286 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 532 aa  1086    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  41.16 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  40.64 
 
 		 575 aa  422  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  41.93 
 
 		 553 aa  407  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  45.67 
 
 		 510 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  45.08 
 
 		 510 aa  403  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  44.49 
 
 		 510 aa  399  9.999999999999999e-111  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  40.82 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  45.36 
 
 		 509 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  40.42 
 
 		 565 aa  396  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  37.95 
 
 		 625 aa  398  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  39.02 
 
 		 575 aa  399  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  38 
 
 		 595 aa  395  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  37.08 
 
 		 590 aa  395  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  38.26 
 
 		 572 aa  395  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 565 aa  389  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  40.77 
 
 		 551 aa  383  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  42 
 
 		 557 aa  384  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  40.7 
 
 		 547 aa  381  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  40.66 
 
 		 517 aa  374  1e-102  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  38.95 
 
 		 556 aa  372  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  40.25 
 
 		 551 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  40.69 
 
 		 551 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 		 550 aa  352  8e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  39.11 
 
 		 542 aa  346  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 		 567 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  36.31 
 
 		 556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  38.34 
 
 		 515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 		 535 aa  288  1e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  23.19 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2047  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.27 
 
 		 497 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731125 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 		 430 aa  54.3  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1766  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.19 
 
 		 496 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0031  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.96 
 
 		 473 aa  54.3  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1875  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.29 
 
 		 490 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0468  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.26 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09080  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.41 
 
 		 442 aa  50.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370572  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0242  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.24 
 
 		 473 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3365  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  21.03 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2692  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.7 
 
 		 474 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  21.86 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0019  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.64 
 
 		 469 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.43689 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3779  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.92 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_004310  BR2153  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.22 
 
 		 467 aa  48.1  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2066  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.22 
 
 		 467 aa  48.1  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0928241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0713  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.25 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124358  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 398 aa  47.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2609  putative tRNA modifying protein  24.2 
 
 		 467 aa  47.8  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3498  hypothetical protein  46.15 
 
 		 101 aa  47.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.183909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.22 
 
 		 462 aa  47.4  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  22.73 
 
 		 480 aa  47.4  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.74 
 
 		 531 aa  47.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1025  helix-hairpin-helix motif protein  46.15 
 
 		 103 aa  47.4  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0837725  normal  0.434373 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.1 
 
 		 498 aa  47  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0547  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.5 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.028203  decreased coverage  0.00348537 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  23.58 
 
 		 369 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.75 
 
 		 477 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.34 
 
 		 523 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761282  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0651  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  23.02 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  21.5 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0584  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  21.15 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0532  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.66 
 
 		 457 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.742382 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0454  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.76 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000369122  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3471  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.75 
 
 		 474 aa  45.4  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000111434  normal  0.160126 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  21.96 
 
 		 451 aa  45.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.81 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.33224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.81 
 
 		 457 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.94 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3137  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.39 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.21345  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3528  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.24 
 
 		 462 aa  44.3  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2721  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.77 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.693601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0185  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.75 
 
 		 440 aa  44.3  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2081  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.77 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.959861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2693  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.77 
 
 		 457 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0419  RNA modification protein  21.26 
 
 		 456 aa  44.3  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.752325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0473  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  22.97 
 
 		 477 aa  43.9  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000440615  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.1 
 
 		 457 aa  43.9  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  22.27 
 
 		 450 aa  43.9  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3399  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.41 
 
 		 446 aa  43.9  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.497739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3733  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.13 
 
 		 441 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2720  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.4 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2358  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.4 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.788985  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0226  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.4 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.703576  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0710  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.4 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.4 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2438  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.4 
 
 		 457 aa  43.5  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2811  helix-hairpin-helix motif protein  45.45 
 
 		 119 aa  43.5  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>