50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2352 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  81.06 
 
 		 565 aa  947    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  78.76 
 
 		 565 aa  955    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 565 aa  1139    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  79.08 
 
 		 565 aa  910    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  50.09 
 
 		 567 aa  487  1e-136  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  42.83 
 
 		 575 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  41.11 
 
 		 566 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  42.86 
 
 		 625 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  44.11 
 
 		 553 aa  425  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  40.58 
 
 		 590 aa  416  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  41.15 
 
 		 572 aa  412  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  40.82 
 
 		 532 aa  408  1.0000000000000001e-112  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  42.12 
 
 		 595 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  42.27 
 
 		 575 aa  404  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  43.48 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  44.12 
 
 		 547 aa  398  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 		 510 aa  393  1e-108  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  42.58 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 		 510 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  42.96 
 
 		 550 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  39.74 
 
 		 542 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  44.12 
 
 		 557 aa  388  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  40.95 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  43.16 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 551 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  39.68 
 
 		 556 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  41.54 
 
 		 517 aa  371  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  39.61 
 
 		 556 aa  350  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  36.78 
 
 		 515 aa  318  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  36.04 
 
 		 535 aa  300  5e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0258  conserved hypothetical protein, radical SAM domain family (UPF0004 domain protein)  23.75 
 
 		 438 aa  55.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 393 aa  55.1  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  27.43 
 
 		 424 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 412 aa  54.3  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 393 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 		 398 aa  53.9  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  25.51 
 
 		 435 aa  51.2  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0256  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.26 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  22.22 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2751  hypothetical protein  22.54 
 
 		 440 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 397 aa  47.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52420  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.64 
 
 		 440 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  25.35 
 
 		 397 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  23.44 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0795  hypothetical protein  27.36 
 
 		 483 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  21.14 
 
 		 416 aa  45.1  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.13 
 
 		 404 aa  45.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>