32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0614 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  100 
 
 
557 aa  1146    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  60.04 
 
 
550 aa  660    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  61.65 
 
 
553 aa  698    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  57.98 
 
 
547 aa  629  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  56.2 
 
 
551 aa  627  1e-178  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  44.8 
 
 
566 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  46.98 
 
 
575 aa  467  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  41.68 
 
 
551 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  42.42 
 
 
625 aa  427  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 
551 aa  426  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  40.88 
 
 
556 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  41.82 
 
 
595 aa  422  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  44.57 
 
 
565 aa  420  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  41.09 
 
 
590 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  41.79 
 
 
575 aa  412  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  40.22 
 
 
572 aa  413  1e-114  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  44.12 
 
 
565 aa  412  1e-114  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  44.02 
 
 
565 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  43.22 
 
 
565 aa  404  1e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  40.71 
 
 
556 aa  393  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  39.7 
 
 
542 aa  394  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  41.56 
 
 
532 aa  394  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  44.14 
 
 
567 aa  377  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  40.78 
 
 
517 aa  359  6e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  40.5 
 
 
515 aa  355  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  39.16 
 
 
535 aa  353  5e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 
510 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  39.21 
 
 
510 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  41.13 
 
 
509 aa  350  4e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  39.41 
 
 
510 aa  350  5e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1623  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.48 
 
 
452 aa  44.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0258  conserved hypothetical protein, radical SAM domain family (UPF0004 domain protein)  24.24 
 
 
438 aa  44.3  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>