52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1460 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  82.94 
 
 
510 aa  870    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  81.37 
 
 
510 aa  857    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  67.5 
 
 
517 aa  714    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
509 aa  1022    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  82.55 
 
 
510 aa  866    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  45.79 
 
 
575 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  42.69 
 
 
566 aa  404  1e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  45.36 
 
 
532 aa  401  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  42.91 
 
 
565 aa  386  1e-106  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  43.16 
 
 
565 aa  384  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  41.56 
 
 
575 aa  379  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  43.08 
 
 
565 aa  377  1e-103  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  42.19 
 
 
565 aa  377  1e-103  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 
553 aa  375  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  40.64 
 
 
595 aa  373  1e-102  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  43.42 
 
 
551 aa  369  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  40.27 
 
 
572 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  43.03 
 
 
551 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  41.44 
 
 
551 aa  364  2e-99  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  38.09 
 
 
625 aa  359  5e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  39.8 
 
 
547 aa  353  4e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  37.91 
 
 
590 aa  348  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 
550 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  41.39 
 
 
557 aa  334  2e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  41.57 
 
 
535 aa  328  2.0000000000000001e-88  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  39.22 
 
 
567 aa  325  1e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  37.82 
 
 
556 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  38.01 
 
 
556 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 
542 aa  318  2e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  40.08 
 
 
515 aa  311  1e-83  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 
398 aa  65.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  21.74 
 
 
436 aa  51.2  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1155  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  21.64 
 
 
474 aa  49.7  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.14 
 
 
435 aa  48.5  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0865  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.7 
 
 
440 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0318613  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  22.68 
 
 
405 aa  48.1  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0034  2-methylthioadenine synthetase  21.1 
 
 
455 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0040  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.08 
 
 
472 aa  47  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000523218 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  23.36 
 
 
466 aa  47  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  23.13 
 
 
377 aa  45.1  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1220  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  21.39 
 
 
474 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.0448145 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1850  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  20.52 
 
 
481 aa  44.7  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0258  conserved hypothetical protein, radical SAM domain family (UPF0004 domain protein)  24.6 
 
 
438 aa  44.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  21.16 
 
 
430 aa  43.9  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
481 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
473 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  26.8 
 
 
473 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
503 aa  43.5  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
481 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
481 aa  43.5  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
473 aa  43.5  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0253  2-methylthioadenine synthetase  28.81 
 
 
444 aa  43.5  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.484105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>