55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1989 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 565 aa  1134    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  79.82 
 
 		 565 aa  960    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  81.06 
 
 		 565 aa  962    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  78.72 
 
 		 565 aa  902    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  47.48 
 
 		 567 aa  476  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  43.71 
 
 		 575 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  41.57 
 
 		 566 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  41.84 
 
 		 625 aa  423  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  40.75 
 
 		 590 aa  419  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  44.34 
 
 		 553 aa  412  1e-114  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  41.09 
 
 		 575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  40.52 
 
 		 595 aa  401  9.999999999999999e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  40.31 
 
 		 572 aa  399  9.999999999999999e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  42.25 
 
 		 510 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  42.14 
 
 		 510 aa  395  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  42.25 
 
 		 510 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  40.11 
 
 		 532 aa  395  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  43.53 
 
 		 547 aa  390  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  40.99 
 
 		 557 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 509 aa  385  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  38.37 
 
 		 556 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  41.08 
 
 		 551 aa  377  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 		 517 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  42.06 
 
 		 550 aa  374  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  39.79 
 
 		 551 aa  375  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  38.1 
 
 		 542 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  39.61 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  37.66 
 
 		 556 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  35.57 
 
 		 515 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  35.45 
 
 		 535 aa  283  6.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  27.5 
 
 		 424 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  24.74 
 
 		 430 aa  55.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  26.26 
 
 		 412 aa  54.7  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 398 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  21.37 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0256  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.72 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 599 aa  50.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  22.65 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 393 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 398 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 410 aa  50.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0258  conserved hypothetical protein, radical SAM domain family (UPF0004 domain protein)  22.22 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  24.38 
 
 		 416 aa  48.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0279  hypothetical protein  25.48 
 
 		 777 aa  46.6  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  23.35 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.77 
 
 		 404 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  21.94 
 
 		 471 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1852  RNA modification enzyme, MiaB family  22.93 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.417031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0233  hypothetical protein  25.1 
 
 		 780 aa  44.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 515 aa  44.3  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  26.23 
 
 		 497 aa  43.9  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1649  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  27.48 
 
 		 374 aa  43.9  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.76 
 
 		 430 aa  43.5  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2609  putative tRNA modifying protein  22.97 
 
 		 467 aa  43.5  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>