190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3028 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  78.71 
 
 		 575 aa  932    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 572 aa  1166    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  76.44 
 
 		 590 aa  897    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  75.3 
 
 		 625 aa  880    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  78.28 
 
 		 595 aa  920    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  45.38 
 
 		 575 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  44.78 
 
 		 566 aa  478  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  42.98 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  42.66 
 
 		 551 aa  424  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  39.26 
 
 		 556 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  43.01 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  42.31 
 
 		 551 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  41.2 
 
 		 542 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  41.15 
 
 		 565 aa  412  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  44.65 
 
 		 547 aa  404  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  42.75 
 
 		 556 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  39.65 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  40.31 
 
 		 565 aa  395  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  40.04 
 
 		 557 aa  394  1e-108  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  38.26 
 
 		 532 aa  395  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  40.31 
 
 		 565 aa  390  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  41.77 
 
 		 550 aa  391  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  40.04 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  37.69 
 
 		 517 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  39.54 
 
 		 510 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  40.27 
 
 		 509 aa  365  1e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 		 567 aa  347  5e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  30.41 
 
 		 398 aa  59.3  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1444  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.51 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 393 aa  54.7  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  24.1 
 
 		 528 aa  54.3  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 542 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1673  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  44.16 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1944  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  44.16 
 
 		 437 aa  53.5  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  43.42 
 
 		 467 aa  52.8  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  20.82 
 
 		 398 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.07 
 
 		 485 aa  52.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125377  hitchhiker  0.0000111604 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 539 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.64 
 
 		 420 aa  52.4  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2303  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  43.42 
 
 		 467 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.941264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  27.63 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 489 aa  51.6  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  25.41 
 
 		 554 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 547 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  40 
 
 		 466 aa  50.4  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 543 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.96 
 
 		 420 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  23.01 
 
 		 368 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  24 
 
 		 523 aa  50.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  36.25 
 
 		 515 aa  50.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  50 
 
 		 547 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  40 
 
 		 458 aa  48.9  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  30.05 
 
 		 547 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3120  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.98 
 
 		 443 aa  49.7  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  50 
 
 		 547 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0935  MiaB-like radical SAM protein  34.02 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.34 
 
 		 419 aa  48.5  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.66 
 
 		 421 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3451  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.89 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0499  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.89 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.717124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3627  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.89 
 
 		 480 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02161  Fe-S oxidoreductase  42.11 
 
 		 472 aa  48.9  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.02 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1787  putative tRNA modifying protein  42.11 
 
 		 454 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.97 
 
 		 422 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0538  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.54 
 
 		 472 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0973  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24 
 
 		 463 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3800  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.54 
 
 		 472 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.02 
 
 		 425 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0517  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.54 
 
 		 472 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0543  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.54 
 
 		 472 aa  48.5  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0515  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.91 
 
 		 443 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.481565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0396  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.02 
 
 		 420 aa  47.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.342498  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1614  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.77 
 
 		 471 aa  48.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0719193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  38.78 
 
 		 527 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.02 
 
 		 416 aa  47.8  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01161  Fe-S oxidoreductase  31.36 
 
 		 462 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1536  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.47 
 
 		 525 aa  47.4  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262193 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  38.78 
 
 		 527 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1715  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.47 
 
 		 531 aa  47.4  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0373  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.04 
 
 		 434 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215959  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 497 aa  47  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 529 aa  47  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01861  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.79 
 
 		 485 aa  46.6  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.322164  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  38 
 
 		 553 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  45.83 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  36.73 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1834  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.96 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.044841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3390  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.1 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2732  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.11 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0599  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.66 
 
 		 449 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1803  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.79 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.6995  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>