142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0927 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 556 aa  1120    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  43.89 
 
 		 551 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  44.07 
 
 		 551 aa  443  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  41.65 
 
 		 566 aa  423  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  42.52 
 
 		 553 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  43.29 
 
 		 572 aa  411  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  42.56 
 
 		 625 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 		 595 aa  405  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  42.57 
 
 		 575 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  42.06 
 
 		 551 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  44.69 
 
 		 550 aa  400  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  40.83 
 
 		 575 aa  398  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  41.68 
 
 		 590 aa  393  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  43.76 
 
 		 547 aa  392  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  38.32 
 
 		 556 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  40.89 
 
 		 557 aa  386  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  41.48 
 
 		 535 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 		 565 aa  371  1e-101  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  39.29 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  39.78 
 
 		 565 aa  363  3e-99  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  39.49 
 
 		 565 aa  351  2e-95  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  37.68 
 
 		 542 aa  342  7e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  36.49 
 
 		 532 aa  342  1e-92  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  37.66 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 567 aa  341  2e-92  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  39.49 
 
 		 510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  39.92 
 
 		 510 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  39.53 
 
 		 510 aa  336  7e-91  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  38.1 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  36.26 
 
 		 517 aa  320  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  34.21 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.68 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.038543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.03 
 
 		 436 aa  56.6  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1361  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  27.33 
 
 		 456 aa  56.2  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  21.98 
 
 		 397 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  22.97 
 
 		 377 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 405 aa  53.9  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.76 
 
 		 434 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1803  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.67 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.6995  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1318  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.85 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0862922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2327  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.85 
 
 		 463 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.85 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143313  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0089  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.85 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2199  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.85 
 
 		 463 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.148907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1078  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.85 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.678525  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1636  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  26.01 
 
 		 453 aa  51.6  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.413832 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  31.03 
 
 		 497 aa  51.6  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2162  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.85 
 
 		 463 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.692729  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1352  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  25.53 
 
 		 452 aa  51.2  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  24.53 
 
 		 495 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3120  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  26.64 
 
 		 443 aa  50.4  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3232  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  27.23 
 
 		 462 aa  50.4  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.653415  normal  0.176593 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  25.11 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6297  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.78 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1782  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.78 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1582  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  25.56 
 
 		 453 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.386337  normal  0.0216178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1911  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  25.56 
 
 		 453 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0408943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4495  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.27 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000507978  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0973  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.27 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  27.32 
 
 		 458 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.14 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  18.84 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0256  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  19.88 
 
 		 430 aa  49.3  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1385  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.74 
 
 		 418 aa  48.5  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000358756  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  25.62 
 
 		 466 aa  48.9  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2259  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.63 
 
 		 463 aa  48.9  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.017952  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0590  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.89 
 
 		 468 aa  48.9  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.632056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0926  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  25.11 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.78 
 
 		 453 aa  48.5  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580296 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18877  predicted protein  24.64 
 
 		 455 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2751  hypothetical protein  22.32 
 
 		 440 aa  47.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1975  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.72 
 
 		 464 aa  47.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00113002  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1722  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.53 
 
 		 453 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 430 aa  47.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2439  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  26.17 
 
 		 461 aa  47.8  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0878  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 509 aa  47.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000778999  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 412 aa  48.1  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3967  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.64 
 
 		 512 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2867  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  25.7 
 
 		 471 aa  47.8  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0721568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5082  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.82 
 
 		 453 aa  47.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4475  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.73 
 
 		 449 aa  47.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.439189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1354  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.1 
 
 		 507 aa  47.4  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1695  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.82 
 
 		 453 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.184719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  32.67 
 
 		 553 aa  47  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_002950  PG0150  hypothetical protein  23.46 
 
 		 434 aa  47  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0082  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.14 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.24 
 
 		 485 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125377  hitchhiker  0.0000111604 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14552  predicted protein  21.23 
 
 		 453 aa  47  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.57073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2701  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  25.23 
 
 		 469 aa  46.6  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0312438  normal  0.2083 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0443  MiaB family RNA modification protein  25.37 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5119  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.73 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.492181  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  21.49 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0915  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.14 
 
 		 452 aa  46.2  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.642339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1848  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.48 
 
 		 461 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0225494  normal  0.052969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.71 
 
 		 477 aa  46.2  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>