More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0443 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_0377  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  81.42 
 
 
450 aa  758    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0641  hypothetical protein  86.14 
 
 
440 aa  799    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2512  hypothetical protein  73.39 
 
 
452 aa  687    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  75.23 
 
 
449 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  75.45 
 
 
449 aa  691    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0443  MiaB family RNA modification protein  100 
 
 
440 aa  905    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3733  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  78.36 
 
 
441 aa  734    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0655484 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0470  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  78.03 
 
 
438 aa  736    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  67.43 
 
 
458 aa  632  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02161  Fe-S oxidoreductase  65.69 
 
 
472 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  66.51 
 
 
466 aa  621  1e-177  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01161  Fe-S oxidoreductase  61.24 
 
 
462 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0106  hypothetical protein  57.67 
 
 
471 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01181  Fe-S oxidoreductase  57.89 
 
 
454 aa  538  9.999999999999999e-153  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.681569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01171  Fe-S oxidoreductase  57.44 
 
 
454 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.72418  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01141  Fe-S oxidoreductase  57.89 
 
 
454 aa  533  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1926  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  45.58 
 
 
444 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587814  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  44.29 
 
 
436 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1074  hypothetical protein  45.98 
 
 
432 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3110  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.89 
 
 
446 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000143108  normal  0.954122 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.27 
 
 
442 aa  363  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000009336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0111  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  44.85 
 
 
469 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0093  hypothetical protein  44.85 
 
 
483 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0100  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  44.62 
 
 
469 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0256489  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0618  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.31 
 
 
448 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000754849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3205  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.89 
 
 
447 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.53 
 
 
450 aa  352  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000316014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0632  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.63 
 
 
448 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.3058599999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.94 
 
 
470 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3205  hypothetical protein  41.53 
 
 
445 aa  349  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000023464  hitchhiker  3.0015199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0716  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.4 
 
 
448 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000599844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3199  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.5 
 
 
449 aa  346  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0034  2-methylthioadenine synthetase  41.31 
 
 
455 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1671  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.18 
 
 
487 aa  343  4e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.813765  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11970  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.14 
 
 
442 aa  342  7e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000060077  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.93 
 
 
453 aa  341  1e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000162674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2498  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.44 
 
 
486 aa  341  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.620801  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1929  putative tRNA modifying protein  42.66 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1647  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  42.44 
 
 
445 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.6 
 
 
440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000298883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0678  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.75 
 
 
446 aa  333  3e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000258003  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0983  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.37 
 
 
440 aa  327  3e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000730864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0735  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.82 
 
 
463 aa  325  1e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.512918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0531  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.09 
 
 
472 aa  324  1e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680198  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0839  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.41 
 
 
450 aa  323  3e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1284  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.66 
 
 
482 aa  323  5e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.323089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.78 
 
 
436 aa  322  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146576  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2144  hypothetical protein  37.19 
 
 
504 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1262  2-methylthioadenine synthetase  40.09 
 
 
439 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.467346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3605  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.64 
 
 
436 aa  313  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.757621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3525  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.06 
 
 
444 aa  312  5.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5359  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39 
 
 
437 aa  312  6.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1673  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.24 
 
 
442 aa  312  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1444  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.61 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1606  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.16 
 
 
456 aa  310  4e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.132217 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.86 
 
 
430 aa  309  5e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1944  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.14 
 
 
437 aa  310  5e-83  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4495  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.54 
 
 
469 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000507978  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0675  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.27 
 
 
430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00122823  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1314  hypothetical protein  39.56 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395672  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0770  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.88 
 
 
457 aa  307  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.579434 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2510  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.96 
 
 
441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105116  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13538  putative Fe-S oxidoreductase  37.98 
 
 
435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.505425  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1063  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.64 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.270511  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1464  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.47 
 
 
440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1025  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.87 
 
 
433 aa  303  3.0000000000000004e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.813856  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0953  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.433184  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0894  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.917524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1003  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.902435  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0920  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00802  predicted SAM-dependent methyltransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.73 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0982  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.195004  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0988  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.479636  normal  0.703934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0862  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.746353  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00819  hypothetical protein  39.73 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0895  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.465773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0906  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26767  predicted protein  39.96 
 
 
450 aa  301  1e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.071035 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.81 
 
 
430 aa  301  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.23 
 
 
453 aa  299  6e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.580296 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1467  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.5 
 
 
444 aa  299  6e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.369998  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.73 
 
 
467 aa  299  7e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5082  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.5 
 
 
453 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3120  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.53 
 
 
443 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6297  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.23 
 
 
453 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1782  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.23 
 
 
453 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339702  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3092  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.96 
 
 
435 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.949904  normal  0.038543 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2732  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.62 
 
 
455 aa  296  5e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106546  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1764  hypothetical protein  40.36 
 
 
443 aa  295  7e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.341507  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0653  2-methylthioadenine synthetase  35.57 
 
 
437 aa  295  8e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.835098  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1197  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.02 
 
 
470 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1228  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.02 
 
 
443 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243595  normal  0.945155 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2303  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.06 
 
 
467 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.941264  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2197  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.92 
 
 
470 aa  295  1e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1722  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  36.8 
 
 
453 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4016  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.97 
 
 
443 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.588155  hitchhiker  0.00937866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2751  hypothetical protein  39.01 
 
 
440 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4219  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.8 
 
 
443 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.862711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>