More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2210 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  75.89 
 
 
420 aa  658    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  77.16 
 
 
417 aa  670    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  76.68 
 
 
417 aa  669    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
434 aa  885    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  69.71 
 
 
424 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.15 
 
 
411 aa  270  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.74 
 
 
430 aa  268  2e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  35.9 
 
 
416 aa  258  1e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.47 
 
 
404 aa  252  7e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  34.38 
 
 
421 aa  249  6e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  35.44 
 
 
418 aa  246  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.16 
 
 
374 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.99 
 
 
422 aa  239  9e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.06 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.55 
 
 
425 aa  233  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.33 
 
 
425 aa  232  1e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.03 
 
 
430 aa  231  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.08 
 
 
425 aa  231  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  36.08 
 
 
415 aa  229  9e-59  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  33.41 
 
 
422 aa  228  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.74 
 
 
428 aa  227  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  35.53 
 
 
416 aa  227  3e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  33.88 
 
 
415 aa  227  3e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.52 
 
 
421 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  34.59 
 
 
440 aa  223  6e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.02 
 
 
449 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  34.64 
 
 
428 aa  212  9e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  30.8 
 
 
442 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.38 
 
 
434 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  31.67 
 
 
516 aa  183  7e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.94 
 
 
434 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2979  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.41 
 
 
459 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122351  hitchhiker  0.00203806 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.73 
 
 
442 aa  177  4e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.89 
 
 
438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  31.61 
 
 
444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  30.35 
 
 
466 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0851  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.75 
 
 
435 aa  173  6.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.154283  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3236  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.54 
 
 
480 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.703732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1591  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.73 
 
 
445 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.712664 
 
 
-
 
NC_002978  WD0421  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.3 
 
 
439 aa  171  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1464  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.42 
 
 
509 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457161 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0252  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.46 
 
 
441 aa  171  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  27.5 
 
 
449 aa  170  5e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.74 
 
 
429 aa  170  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1881  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.71 
 
 
476 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0415233  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.82 
 
 
512 aa  169  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000618798  normal  0.207012 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.82 
 
 
471 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1155  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.07 
 
 
474 aa  168  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1462  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.11 
 
 
522 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1793  RNA modification enzyme, MiaB family  29.15 
 
 
503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1220  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.93 
 
 
474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.0448145 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0065  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.58 
 
 
451 aa  167  4e-40  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.63 
 
 
432 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0832  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.43 
 
 
471 aa  167  5e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1166  tRNA I(6) A37 thitransferase miaB family  30.61 
 
 
418 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000228736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.56 
 
 
451 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000417118  normal  0.0490217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1047  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.05 
 
 
438 aa  166  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000312807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2225  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30 
 
 
502 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3911  RNA modification enzyme, MiaB family  30.95 
 
 
483 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3134  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.51 
 
 
474 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  27.93 
 
 
482 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.94 
 
 
439 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.77 
 
 
437 aa  164  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1385  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.82 
 
 
418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000358756  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1195  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.34 
 
 
418 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00789069  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0963  RNA modification enzyme, MiaB family  27.82 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1108  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.44 
 
 
476 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4821  RNA modification enzyme, MiaB family  28.14 
 
 
521 aa  163  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  28.97 
 
 
473 aa  163  6e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  30.69 
 
 
454 aa  163  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  30.67 
 
 
438 aa  163  6e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3399  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.95 
 
 
446 aa  163  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.497739  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  30.65 
 
 
431 aa  163  7e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1850  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.54 
 
 
481 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2062  RNA modification enzyme, MiaB family  28.73 
 
 
482 aa  162  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2153  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.57 
 
 
467 aa  161  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0811  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.05 
 
 
494 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2066  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.57 
 
 
467 aa  161  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0928241  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.57 
 
 
462 aa  161  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  32.49 
 
 
433 aa  161  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2173  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.44 
 
 
442 aa  162  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1829  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.43 
 
 
482 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3005  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.2 
 
 
509 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187543  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.57 
 
 
438 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2915  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.2 
 
 
474 aa  161  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000321738  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  30.13 
 
 
436 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3033  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.7 
 
 
456 aa  160  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1197  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.34 
 
 
474 aa  161  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2948  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.81 
 
 
476 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.51 
 
 
471 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0437  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.51 
 
 
477 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  31.14 
 
 
448 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.19 
 
 
409 aa  160  5e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07250  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.96 
 
 
515 aa  160  5e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.673906  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  29.7 
 
 
437 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  31.14 
 
 
448 aa  160  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  28.64 
 
 
478 aa  159  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.3 
 
 
450 aa  160  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.37 
 
 
456 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3204  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.23 
 
 
446 aa  159  7e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>