More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2951 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  74.11 
 
 
420 aa  648    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  92.33 
 
 
417 aa  799    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  76.68 
 
 
434 aa  669    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
417 aa  859    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  68.9 
 
 
424 aa  593  1e-168  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.25 
 
 
411 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.36 
 
 
430 aa  260  3e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.56 
 
 
420 aa  251  1e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  35.41 
 
 
416 aa  247  2e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.44 
 
 
374 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  35.59 
 
 
418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.96 
 
 
404 aa  233  7.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  32.85 
 
 
421 aa  230  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.42 
 
 
422 aa  226  4e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.71 
 
 
430 aa  224  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.7 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.48 
 
 
449 aa  218  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  32.35 
 
 
422 aa  213  3.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.17 
 
 
425 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.69 
 
 
425 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  30.82 
 
 
442 aa  209  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.78 
 
 
421 aa  208  1e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  33.73 
 
 
415 aa  207  3e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  32.41 
 
 
415 aa  206  4e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.98 
 
 
425 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  33.18 
 
 
416 aa  204  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  33.6 
 
 
428 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  31.54 
 
 
440 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  32.21 
 
 
516 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.72 
 
 
429 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.85 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.52 
 
 
434 aa  171  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0832  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  29.74 
 
 
471 aa  168  2e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.77 
 
 
438 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.59 
 
 
442 aa  166  8e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2979  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.72 
 
 
459 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122351  hitchhiker  0.00203806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1591  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.67 
 
 
445 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.712664 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.97 
 
 
438 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0252  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.74 
 
 
441 aa  161  2e-38  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0367  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.16 
 
 
440 aa  161  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.313304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  28.54 
 
 
447 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3872  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.21 
 
 
436 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0421  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.4 
 
 
439 aa  160  3e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  28.96 
 
 
473 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  27.96 
 
 
466 aa  159  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0697  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.63 
 
 
462 aa  159  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.224906 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1155  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.86 
 
 
474 aa  159  1e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  28.67 
 
 
438 aa  158  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0851  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.87 
 
 
435 aa  157  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.154283  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1076  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.67 
 
 
441 aa  157  3e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.24 
 
 
438 aa  157  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  30.85 
 
 
435 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.21 
 
 
440 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3285  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.03 
 
 
436 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.38 
 
 
421 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.47 
 
 
437 aa  155  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.47 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07250  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  28.03 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.673906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.31 
 
 
462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4167  RNA modification enzyme, MiaB family  28.01 
 
 
495 aa  153  5e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.57 
 
 
446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  25.97 
 
 
449 aa  152  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.07 
 
 
450 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3617  RNA modification protein  32.64 
 
 
467 aa  152  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1793  RNA modification enzyme, MiaB family  28.08 
 
 
503 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1647  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  31.04 
 
 
445 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.51 
 
 
456 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2153  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.3 
 
 
467 aa  152  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2066  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.3 
 
 
467 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0928241  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3600  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.77 
 
 
436 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1617  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.52 
 
 
509 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00553824  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0590  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.02 
 
 
468 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.632056  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.33 
 
 
409 aa  152  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1929  putative tRNA modifying protein  31.04 
 
 
445 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  29.17 
 
 
437 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1243  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.95 
 
 
458 aa  152  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.23 
 
 
409 aa  152  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2355  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.83 
 
 
464 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0242  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.08 
 
 
473 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.51 
 
 
456 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0582  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.95 
 
 
444 aa  151  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362329  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0065  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.22 
 
 
451 aa  151  2e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.01 
 
 
450 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2062  RNA modification enzyme, MiaB family  27.01 
 
 
482 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  30.75 
 
 
436 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1999  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.79 
 
 
441 aa  151  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.67 
 
 
441 aa  151  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3285  RNA modification enzyme, MiaB family  28.64 
 
 
497 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0343128  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3701  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.33 
 
 
445 aa  151  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0893  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.32 
 
 
474 aa  151  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188426  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0237  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.25 
 
 
446 aa  150  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.956041  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.35 
 
 
429 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3847  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.5 
 
 
496 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2225  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  28.67 
 
 
502 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  30.47 
 
 
451 aa  150  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  32.39 
 
 
433 aa  150  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.63 
 
 
512 aa  149  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000618798  normal  0.207012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30 
 
 
477 aa  149  7e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1850  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.31 
 
 
481 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  29.83 
 
 
431 aa  149  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>