More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1050 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 		 438 aa  891    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  49.75 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  40.73 
 
 		 434 aa  345  6e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.82 
 
 		 438 aa  343  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  42.08 
 
 		 434 aa  339  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.51 
 
 		 471 aa  333  3e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.73 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.95 
 
 		 449 aa  332  6e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  40.79 
 
 		 454 aa  329  6e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  40 
 
 		 449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.22 
 
 		 444 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  40.05 
 
 		 451 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.85 
 
 		 431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  40.58 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  37.67 
 
 		 450 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.43 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.67 
 
 		 450 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.62 
 
 		 434 aa  312  9e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.16 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  37.94 
 
 		 450 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  41.29 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  37.7 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  37.7 
 
 		 450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  37.18 
 
 		 446 aa  307  2.0000000000000002e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  37.7 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  37.7 
 
 		 450 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  37.7 
 
 		 450 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  37.7 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  37.7 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.63 
 
 		 441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.25 
 
 		 432 aa  305  8.000000000000001e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  37.88 
 
 		 448 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  37.88 
 
 		 448 aa  305  8.000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  37.47 
 
 		 450 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  37.47 
 
 		 450 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  37.04 
 
 		 448 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  39.15 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.69 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.1 
 
 		 495 aa  301  2e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.53 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.65 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.96 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  36.48 
 
 		 437 aa  291  1e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.03 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.19 
 
 		 434 aa  289  5.0000000000000004e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.06 
 
 		 466 aa  289  6e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.19 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  38.37 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  36.08 
 
 		 441 aa  286  5e-76  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.9 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.5 
 
 		 425 aa  279  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  37.9 
 
 		 439 aa  279  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  37.25 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.5 
 
 		 429 aa  277  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.16 
 
 		 442 aa  276  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.91 
 
 		 449 aa  272  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.95 
 
 		 442 aa  269  8e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.65 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  31.46 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.15 
 
 		 427 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.15 
 
 		 420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.49 
 
 		 421 aa  254  3e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.71 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.57 
 
 		 444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.01 
 
 		 419 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3229  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.8 
 
 		 416 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0152656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2775  2-methylthioadenine synthetase  35.51 
 
 		 422 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.254506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.44 
 
 		 441 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.38 
 
 		 425 aa  249  5e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  34.6 
 
 		 427 aa  249  6e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.88 
 
 		 423 aa  249  7e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  35.32 
 
 		 427 aa  249  9e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  35.32 
 
 		 427 aa  249  9e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.42 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.09 
 
 		 411 aa  248  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  35.02 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.04 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  34.62 
 
 		 446 aa  246  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0396  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.4 
 
 		 420 aa  246  4.9999999999999997e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.342498  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0935  MiaB-like radical SAM protein  35.04 
 
 		 425 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.6 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.1 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.38 
 
 		 422 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  33.18 
 
 		 436 aa  242  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0515  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.77 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.481565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.19 
 
 		 416 aa  242  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.39 
 
 		 423 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.95 
 
 		 434 aa  240  4e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.28 
 
 		 420 aa  240  5e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  32.8 
 
 		 452 aa  239  8e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  31.59 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  33.18 
 
 		 416 aa  237  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2722  hypothetical protein  33.51 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.72 
 
 		 408 aa  235  9e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.87 
 
 		 467 aa  235  9e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.78 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.25 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  31.9 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0412  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.93 
 
 		 437 aa  234  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.908018  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.05 
 
 		 420 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0176423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>