More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1331 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 		 417 aa  851    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  41.76 
 
 		 436 aa  339  5e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  42.7 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.24 
 
 		 450 aa  319  7e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  41.18 
 
 		 448 aa  313  4.999999999999999e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  40.93 
 
 		 448 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  40.93 
 
 		 448 aa  310  2e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.78 
 
 		 449 aa  309  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  40.09 
 
 		 450 aa  308  8e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  39.23 
 
 		 434 aa  308  8e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  41.88 
 
 		 435 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  39.49 
 
 		 454 aa  306  3e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  39.42 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  39.42 
 
 		 450 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  39.2 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  39.2 
 
 		 450 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.56 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  39.2 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  39.2 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  39.2 
 
 		 450 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  39.2 
 
 		 450 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  39.2 
 
 		 450 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  41.3 
 
 		 451 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  39.44 
 
 		 437 aa  300  3e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  38.75 
 
 		 450 aa  299  5e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  38.86 
 
 		 434 aa  294  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  39.63 
 
 		 449 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.67 
 
 		 471 aa  292  8e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.36 
 
 		 450 aa  289  8e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  41.15 
 
 		 439 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.5 
 
 		 456 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.84 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.82 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.82 
 
 		 434 aa  280  3e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.96 
 
 		 429 aa  279  6e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.42 
 
 		 466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.91 
 
 		 429 aa  272  7e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.48 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.06 
 
 		 434 aa  271  2e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  34.34 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.97 
 
 		 434 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.04 
 
 		 434 aa  269  8e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.43 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.61 
 
 		 430 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  35.95 
 
 		 436 aa  266  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.32 
 
 		 427 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.14 
 
 		 421 aa  260  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.41 
 
 		 409 aa  259  5.0000000000000005e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  36.54 
 
 		 431 aa  259  8e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.11 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.85 
 
 		 442 aa  255  9e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.21 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.92 
 
 		 443 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.41 
 
 		 495 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36 
 
 		 431 aa  249  9e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  33.49 
 
 		 480 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0689  RNA modification enzyme, MiaB family  36.98 
 
 		 440 aa  242  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  35.58 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.48 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1195  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.64 
 
 		 418 aa  239  8e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00789069  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  35.57 
 
 		 413 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.72 
 
 		 439 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_002936  DET1385  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.07 
 
 		 418 aa  237  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000358756  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  35.65 
 
 		 446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.36 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.78 
 
 		 438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  34.52 
 
 		 451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.45 
 
 		 467 aa  233  5e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.3 
 
 		 441 aa  233  6e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.98 
 
 		 449 aa  233  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.98 
 
 		 449 aa  233  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0459  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.2 
 
 		 453 aa  232  8.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.240377  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  33.73 
 
 		 441 aa  231  1e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  36.11 
 
 		 427 aa  230  3e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  36.11 
 
 		 427 aa  230  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  33.49 
 
 		 443 aa  230  4e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0626  RNA modification enzyme, MiaB family  33.76 
 
 		 439 aa  230  4e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.196268  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.79 
 
 		 471 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1166  tRNA I(6) A37 thitransferase miaB family  34.89 
 
 		 418 aa  229  9e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000228736  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0811  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.18 
 
 		 494 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.23 
 
 		 419 aa  227  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.18 
 
 		 494 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  32.65 
 
 		 427 aa  227  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  33.09 
 
 		 470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  35.52 
 
 		 458 aa  226  6e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3847  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.43 
 
 		 496 aa  226  6e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  31.72 
 
 		 478 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  33.07 
 
 		 447 aa  225  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.85 
 
 		 420 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.79 
 
 		 421 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.67 
 
 		 471 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10770  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  31.64 
 
 		 451 aa  224  3e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.46991  unclonable  0.00000000221813 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  31.74 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1076  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.26 
 
 		 441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  32.95 
 
 		 438 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4197  hypothetical protein  33.51 
 
 		 424 aa  223  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.07 
 
 		 444 aa  222  9e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2445  RNA modification enzyme, MiaB family  33.66 
 
 		 417 aa  222  9e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.839572  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.21 
 
 		 425 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.19 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000213731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>