More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1997 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  99.54 
 
 		 434 aa  875    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 		 434 aa  878    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  50.69 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  51.74 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  47.1 
 
 		 454 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  45.85 
 
 		 434 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  50.24 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  45.39 
 
 		 451 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  45.24 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  45.24 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  44.57 
 
 		 448 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  44.98 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  43.75 
 
 		 449 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  44.7 
 
 		 450 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.11 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  43.98 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  44.08 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  44.08 
 
 		 450 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  43.84 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  43.94 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  43.84 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  43.84 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  43.94 
 
 		 450 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  43.84 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  43.84 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  43.84 
 
 		 450 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.23 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.27 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.55 
 
 		 471 aa  366  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.51 
 
 		 450 aa  362  6e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  44.78 
 
 		 439 aa  350  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  40.32 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  40.51 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.14 
 
 		 444 aa  336  5e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.79 
 
 		 431 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.77 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.58 
 
 		 434 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.55 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.89 
 
 		 430 aa  317  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.91 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.83 
 
 		 432 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.14 
 
 		 456 aa  311  1e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.89 
 
 		 435 aa  311  2e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.65 
 
 		 429 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  38.26 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.2 
 
 		 425 aa  309  6.999999999999999e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  35.48 
 
 		 441 aa  308  9e-83  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.08 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.98 
 
 		 441 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.21 
 
 		 427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.56 
 
 		 442 aa  300  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.36 
 
 		 442 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  38.44 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  36.58 
 
 		 440 aa  291  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.19 
 
 		 438 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.22 
 
 		 438 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.82 
 
 		 417 aa  280  3e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  34.82 
 
 		 458 aa  278  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.84 
 
 		 451 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  35.45 
 
 		 446 aa  277  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  36.05 
 
 		 452 aa  272  7e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.28 
 
 		 471 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.65 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  35.17 
 
 		 480 aa  268  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.4 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.92 
 
 		 429 aa  263  3e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1749  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.73 
 
 		 451 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000349639  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.42 
 
 		 444 aa  262  8e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  36.1 
 
 		 440 aa  260  3e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  34.47 
 
 		 450 aa  260  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0459  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.43 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.240377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6072  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.92 
 
 		 449 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0928741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.89 
 
 		 495 aa  257  2e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  33.1 
 
 		 447 aa  256  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  33.33 
 
 		 443 aa  256  7e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  33.57 
 
 		 436 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.31 
 
 		 421 aa  254  2.0000000000000002e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.75 
 
 		 411 aa  254  2.0000000000000002e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.17 
 
 		 531 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  33.49 
 
 		 470 aa  252  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.77 
 
 		 523 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761282  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  33.03 
 
 		 444 aa  249  6e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.87 
 
 		 456 aa  249  7e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000213731  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.41 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.09 
 
 		 447 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  33.8 
 
 		 451 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.09 
 
 		 447 aa  246  4e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0437  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.12 
 
 		 477 aa  246  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  32.07 
 
 		 413 aa  246  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.11 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2599  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  33.03 
 
 		 487 aa  242  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000474817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3543  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.24 
 
 		 509 aa  242  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0128705  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2424  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.32 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.11 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.39 
 
 		 409 aa  240  2.9999999999999997e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.46 
 
 		 416 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0849  RNA modification enzyme, MiaB family  32.06 
 
 		 458 aa  240  4e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.11 
 
 		 471 aa  240  4e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3871  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.79 
 
 		 509 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  33.72 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>