More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2241 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  100 
 
 
454 aa  930    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  59.95 
 
 
434 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.04 
 
 
449 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  47.93 
 
 
436 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  50.23 
 
 
434 aa  450  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.1 
 
 
434 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.87 
 
 
434 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  46.17 
 
 
448 aa  427  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  47.59 
 
 
435 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  46.4 
 
 
448 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  46.4 
 
 
448 aa  422  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  46.3 
 
 
449 aa  420  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  44.7 
 
 
450 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  44.81 
 
 
450 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  44.81 
 
 
450 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  45.39 
 
 
451 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  44.58 
 
 
450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  44.58 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  44.58 
 
 
450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  44.58 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  44.58 
 
 
450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  44.58 
 
 
450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  44.58 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  44.58 
 
 
450 aa  405  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.45 
 
 
438 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  49.06 
 
 
466 aa  403  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.35 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.24 
 
 
450 aa  398  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  46.96 
 
 
431 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.32 
 
 
471 aa  377  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  45.75 
 
 
439 aa  368  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  43.99 
 
 
446 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  42.39 
 
 
437 aa  352  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.1 
 
 
429 aa  348  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.69 
 
 
429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.65 
 
 
430 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.51 
 
 
444 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.79 
 
 
438 aa  329  6e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.14 
 
 
432 aa  326  5e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.24 
 
 
431 aa  325  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  37.44 
 
 
441 aa  322  6e-87  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.84 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.41 
 
 
456 aa  321  9.999999999999999e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.45 
 
 
434 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.09 
 
 
435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.49 
 
 
417 aa  306  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.77 
 
 
442 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.6 
 
 
449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  36.85 
 
 
438 aa  306  6e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.94 
 
 
442 aa  301  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  35.71 
 
 
458 aa  301  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.63 
 
 
444 aa  297  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.12 
 
 
425 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  36.82 
 
 
413 aa  296  6e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  34.67 
 
 
440 aa  296  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.21 
 
 
441 aa  295  2e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  36.21 
 
 
436 aa  290  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.7 
 
 
427 aa  289  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  35.87 
 
 
416 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.67 
 
 
416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.68 
 
 
434 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  37.5 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  38.07 
 
 
451 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.46 
 
 
495 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0849  RNA modification enzyme, MiaB family  34.46 
 
 
458 aa  281  2e-74  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.22 
 
 
434 aa  278  1e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.92 
 
 
429 aa  277  3e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.8 
 
 
451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  33.79 
 
 
440 aa  274  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  33.33 
 
 
444 aa  272  7e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1560  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.3 
 
 
411 aa  271  2e-71  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.19 
 
 
437 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.55 
 
 
444 aa  269  8.999999999999999e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.13 
 
 
438 aa  269  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  34.18 
 
 
450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  34.24 
 
 
480 aa  266  4e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  33.56 
 
 
447 aa  266  5e-70  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  33.77 
 
 
458 aa  265  8.999999999999999e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  31.59 
 
 
443 aa  263  4e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  34.09 
 
 
452 aa  263  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.28 
 
 
471 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  34.95 
 
 
478 aa  260  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3037  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.52 
 
 
454 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.41 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.41 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6072  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34 
 
 
449 aa  253  7e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0928741  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.79 
 
 
443 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.79 
 
 
443 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2835  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.97 
 
 
446 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1076  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.02 
 
 
441 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3288  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.97 
 
 
451 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1749  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.4 
 
 
451 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000349639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.89 
 
 
456 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000213731  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2374  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.52 
 
 
452 aa  249  5e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.997714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.04 
 
 
467 aa  249  9e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1484  RNA modification enzyme, MiaB family  31.87 
 
 
497 aa  248  2e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.02 
 
 
494 aa  248  2e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3911  RNA modification enzyme, MiaB family  33.1 
 
 
483 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.93 
 
 
467 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.356557  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0566  hypothetical protein  34.2 
 
 
470 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.59061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>