More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07660 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
409 aa  840    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10340  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.31 
 
 
409 aa  417  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0729922  unclonable  0.00000000167703 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1645  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.04 
 
 
410 aa  395  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.447021  hitchhiker  0.00298865 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0795  RNA modification enzyme, MiaB family  40.29 
 
 
423 aa  271  1e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.134555  normal  0.773593 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  39.65 
 
 
451 aa  250  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  41.1 
 
 
450 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  40.62 
 
 
450 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  40.62 
 
 
450 aa  249  5e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  40.62 
 
 
450 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  40.62 
 
 
450 aa  249  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  40.62 
 
 
450 aa  249  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  40.62 
 
 
450 aa  249  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  40.62 
 
 
450 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.05 
 
 
450 aa  249  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  40.62 
 
 
450 aa  248  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  40.62 
 
 
450 aa  248  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  40 
 
 
450 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  40.37 
 
 
449 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  40.63 
 
 
437 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.47 
 
 
434 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  35.99 
 
 
446 aa  242  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.8 
 
 
438 aa  241  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  37.32 
 
 
436 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  39.9 
 
 
439 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.25 
 
 
429 aa  237  3e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  36.34 
 
 
434 aa  236  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.41 
 
 
434 aa  236  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  34.4 
 
 
431 aa  232  9e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  37.63 
 
 
435 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  37.09 
 
 
448 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  37.09 
 
 
448 aa  230  4e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.07 
 
 
449 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  37.03 
 
 
448 aa  226  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.81 
 
 
431 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.18 
 
 
471 aa  223  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.42 
 
 
421 aa  223  4e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.57 
 
 
441 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.41 
 
 
432 aa  223  6e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.94 
 
 
429 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.89 
 
 
444 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.84 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  33.84 
 
 
454 aa  219  6e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.36 
 
 
495 aa  219  7e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.17 
 
 
420 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.19 
 
 
449 aa  217  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.04 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.19 
 
 
434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  35.44 
 
 
436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.74 
 
 
420 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  33.96 
 
 
438 aa  216  8e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.66 
 
 
451 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0673  RNA modification enzyme, MiaB family  36.36 
 
 
496 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.323598 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  35.9 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  32.85 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.18 
 
 
429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2225  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  35.58 
 
 
502 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1442  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.98 
 
 
499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2445  RNA modification enzyme, MiaB family  33.42 
 
 
417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.839572  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  35.01 
 
 
440 aa  212  7.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.88 
 
 
494 aa  212  7.999999999999999e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.58 
 
 
438 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.63 
 
 
450 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.18 
 
 
427 aa  211  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.65 
 
 
444 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.02 
 
 
422 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.66 
 
 
425 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  34.77 
 
 
416 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.92 
 
 
443 aa  210  4e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0515  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.57 
 
 
443 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.481565  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3285  RNA modification enzyme, MiaB family  36.1 
 
 
497 aa  209  7e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0343128  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.37 
 
 
439 aa  209  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.24 
 
 
442 aa  208  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.41 
 
 
423 aa  207  2e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.11 
 
 
409 aa  207  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3967  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.32 
 
 
512 aa  207  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  32.66 
 
 
427 aa  207  3e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.66 
 
 
442 aa  206  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0976  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.44 
 
 
467 aa  206  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0149677  normal  0.0700259 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.84 
 
 
456 aa  206  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2852  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.97 
 
 
444 aa  206  6e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.31 
 
 
408 aa  206  8e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1126  RNA modification enzyme, MiaB family  36.01 
 
 
498 aa  206  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.152037 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2064  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.85 
 
 
444 aa  205  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.7 
 
 
466 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3405  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.17 
 
 
435 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0412  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.34 
 
 
437 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.908018  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1488  RNA modification protein  35.73 
 
 
497 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2203  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.62 
 
 
529 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.2 
 
 
449 aa  203  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2157  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.62 
 
 
525 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3847  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.32 
 
 
496 aa  203  4e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2144  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.54 
 
 
526 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00154343 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.07 
 
 
438 aa  203  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.97 
 
 
416 aa  202  9e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.19 
 
 
512 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000618798  normal  0.207012 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.25 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.25 
 
 
434 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4167  RNA modification enzyme, MiaB family  34.78 
 
 
495 aa  202  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672676 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2429  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.34 
 
 
510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  32.9 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000417118  normal  0.0490217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>