More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_14633 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  100 
 
 
516 aa  1065    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.18 
 
 
422 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  32.79 
 
 
421 aa  250  4e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  33.42 
 
 
418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.72 
 
 
404 aa  234  3e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  33.25 
 
 
422 aa  230  5e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.19 
 
 
430 aa  216  8e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.91 
 
 
430 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.75 
 
 
411 aa  210  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  29.36 
 
 
442 aa  209  8e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  31.62 
 
 
416 aa  203  5e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.78 
 
 
420 aa  203  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.48 
 
 
425 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  31.75 
 
 
428 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.61 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.35 
 
 
425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.97 
 
 
449 aa  196  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  33.33 
 
 
415 aa  195  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.87 
 
 
494 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  32.6 
 
 
415 aa  194  4e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  32.13 
 
 
436 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.5 
 
 
421 aa  191  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  30.53 
 
 
450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  30.53 
 
 
450 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  30.35 
 
 
450 aa  190  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  30.68 
 
 
450 aa  190  7e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  30.68 
 
 
450 aa  190  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  29.57 
 
 
450 aa  189  8e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.52 
 
 
438 aa  189  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  30.11 
 
 
450 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  30.31 
 
 
450 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  30.31 
 
 
450 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  30.11 
 
 
450 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10770  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  30.38 
 
 
451 aa  187  5e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.46991  unclonable  0.00000000221813 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  30.26 
 
 
450 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  30.31 
 
 
450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.21 
 
 
417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  31.29 
 
 
455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0106  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.71 
 
 
454 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.027127 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.9 
 
 
424 aa  182  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.67 
 
 
434 aa  182  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3037  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.56 
 
 
454 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.31 
 
 
417 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.91 
 
 
443 aa  182  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.49 
 
 
434 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.91 
 
 
443 aa  182  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1044  RNA modification enzyme, MiaB family  32.4 
 
 
534 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.852588  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2374  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.07 
 
 
452 aa  181  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.997714 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.88 
 
 
420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.24 
 
 
374 aa  181  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  31.39 
 
 
444 aa  181  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.21 
 
 
437 aa  180  4.999999999999999e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.07 
 
 
450 aa  180  4.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2835  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.5 
 
 
446 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17251  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.08 
 
 
463 aa  180  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  32.38 
 
 
439 aa  180  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.87 
 
 
434 aa  180  7e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3288  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.5 
 
 
451 aa  179  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0473  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  29.85 
 
 
477 aa  179  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000440615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1126  RNA modification enzyme, MiaB family  32.64 
 
 
498 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.152037 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.96 
 
 
531 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  32.51 
 
 
435 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1499  RNA modification enzyme, MiaB family  31.08 
 
 
510 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353908  normal  0.351576 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19921  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.5 
 
 
480 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.135238 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4999  MiaB family RNA modification protein  30.4 
 
 
453 aa  178  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1617  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.73 
 
 
509 aa  177  3e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00553824  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1515  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.07 
 
 
442 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.561512  normal  0.183018 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0871  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.07 
 
 
463 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3329  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.68 
 
 
457 aa  177  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1464  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.93 
 
 
509 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0630  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.35 
 
 
457 aa  177  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.798286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00446  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.26 
 
 
460 aa  176  6e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00312623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0377  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30 
 
 
451 aa  177  6e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115898  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3847  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.12 
 
 
496 aa  177  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.4 
 
 
467 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.356557  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1552  RNA modification enzyme, MiaB family  32.92 
 
 
538 aa  176  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0045264 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3625  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.92 
 
 
448 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0208192  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3285  RNA modification enzyme, MiaB family  32.39 
 
 
497 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0343128  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2935  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.24 
 
 
448 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  28.96 
 
 
449 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1488  RNA modification protein  32.75 
 
 
497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  31.39 
 
 
440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1614  RNA modification enzyme, MiaB family  29.58 
 
 
459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00466996  unclonable  5.55218e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.41 
 
 
431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  30.58 
 
 
416 aa  174  5e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.59 
 
 
484 aa  174  5e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.154545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2225  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.09 
 
 
502 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.03 
 
 
451 aa  173  5e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31 
 
 
428 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1248  RNA modification enzyme, MiaB family  32.99 
 
 
543 aa  173  7.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0437289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23170  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.96 
 
 
557 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.144121 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0811  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.13 
 
 
494 aa  172  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0673  RNA modification enzyme, MiaB family  32.99 
 
 
496 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.323598 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1484  RNA modification enzyme, MiaB family  29.04 
 
 
497 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3986  RNA modification enzyme, MiaB family  29.87 
 
 
508 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219223  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2424  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.26 
 
 
509 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1859  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.49 
 
 
448 aa  171  2e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3543  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.57 
 
 
509 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0128705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  29.53 
 
 
446 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.41 
 
 
471 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>