More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0657 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  100 
 
 
418 aa  858    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  61.69 
 
 
421 aa  555  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  42.39 
 
 
428 aa  331  2e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  39.06 
 
 
422 aa  293  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.23 
 
 
411 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.81 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.32 
 
 
421 aa  281  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.34 
 
 
425 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.63 
 
 
449 aa  276  6e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.83 
 
 
422 aa  275  7e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.81 
 
 
425 aa  273  3e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.1 
 
 
425 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  39.53 
 
 
415 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  39.16 
 
 
415 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  35.63 
 
 
416 aa  256  4e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  38.57 
 
 
416 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.88 
 
 
430 aa  253  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.61 
 
 
420 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.44 
 
 
434 aa  246  4e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  37.44 
 
 
440 aa  245  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.33 
 
 
430 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.25 
 
 
417 aa  239  9e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.59 
 
 
417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  33.42 
 
 
516 aa  235  8e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  31.75 
 
 
442 aa  233  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.53 
 
 
424 aa  231  2e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.33 
 
 
420 aa  229  7e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.27 
 
 
374 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  33.79 
 
 
445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  33.26 
 
 
438 aa  211  2e-53  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  32.67 
 
 
446 aa  205  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.28 
 
 
438 aa  205  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0454  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.74 
 
 
430 aa  205  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000369122  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  31.28 
 
 
434 aa  205  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  31.67 
 
 
450 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  32.66 
 
 
447 aa  202  8e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  32.72 
 
 
444 aa  202  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.78 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2225  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  32.73 
 
 
502 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0483  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.41 
 
 
433 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2979  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.17 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122351  hitchhiker  0.00203806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1126  RNA modification enzyme, MiaB family  31.99 
 
 
498 aa  201  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.152037 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  31.88 
 
 
454 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0811  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.2 
 
 
494 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.09 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4167  RNA modification enzyme, MiaB family  32.67 
 
 
495 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.09 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  32.43 
 
 
451 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0421  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.01 
 
 
439 aa  198  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0508  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.94 
 
 
433 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0463062  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.98 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1852  RNA modification enzyme, MiaB family  32.71 
 
 
440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.417031  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.89 
 
 
417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1793  RNA modification enzyme, MiaB family  33.91 
 
 
503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.14 
 
 
451 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  33.08 
 
 
437 aa  197  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  31.48 
 
 
436 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1481  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.48 
 
 
433 aa  196  6e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  29.75 
 
 
450 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0673  RNA modification enzyme, MiaB family  33.33 
 
 
496 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.518988  normal  0.323598 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.88 
 
 
523 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761282  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1353  RNA modification protein  31.58 
 
 
450 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.707059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  31.19 
 
 
449 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  29.91 
 
 
450 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  29.91 
 
 
450 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  31.26 
 
 
439 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.3 
 
 
494 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.17 
 
 
447 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  28.77 
 
 
449 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.73 
 
 
429 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  29.91 
 
 
450 aa  194  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.01 
 
 
450 aa  194  3e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  29.91 
 
 
450 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1369  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.64 
 
 
459 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.121645  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.9 
 
 
430 aa  193  5e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.86 
 
 
434 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.44 
 
 
450 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3285  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.8 
 
 
436 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  29.67 
 
 
450 aa  193  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  29.67 
 
 
450 aa  193  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0697  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.12 
 
 
462 aa  192  6e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.224906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1047  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.41 
 
 
438 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000312807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14661  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.7 
 
 
464 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.222068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1617  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.42 
 
 
509 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00553824  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  29.67 
 
 
450 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2115  RNA modification enzyme, MiaB family  31.79 
 
 
440 aa  192  8e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.732779  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.11 
 
 
438 aa  192  9e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.63 
 
 
427 aa  192  9e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  30.35 
 
 
448 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1881  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.56 
 
 
476 aa  192  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0415233  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.17 
 
 
484 aa  192  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.154545  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3600  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.57 
 
 
436 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  31.34 
 
 
435 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0429  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.8 
 
 
438 aa  192  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3543  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.15 
 
 
509 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0128705  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  30.35 
 
 
448 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.28 
 
 
531 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  29.3 
 
 
450 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  31.45 
 
 
470 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.77 
 
 
440 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000298883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>