More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0557 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  92.33 
 
 
417 aa  799    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  77.16 
 
 
434 aa  670    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
417 aa  857    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  74.11 
 
 
420 aa  645    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  69.14 
 
 
424 aa  595  1e-169  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40 
 
 
411 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.58 
 
 
430 aa  258  1e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  34.44 
 
 
416 aa  247  3e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  35.25 
 
 
418 aa  239  9e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.78 
 
 
374 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.28 
 
 
420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  32.21 
 
 
421 aa  230  3e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.7 
 
 
404 aa  228  2e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.17 
 
 
422 aa  221  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.71 
 
 
430 aa  220  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.63 
 
 
449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  33.1 
 
 
415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  30.52 
 
 
442 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.02 
 
 
421 aa  209  5e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.16 
 
 
428 aa  209  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  34.03 
 
 
415 aa  209  9e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  31.29 
 
 
422 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  33.41 
 
 
416 aa  207  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.42 
 
 
425 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.69 
 
 
425 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.45 
 
 
425 aa  204  2e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  34.59 
 
 
428 aa  195  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  31.09 
 
 
440 aa  191  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  32.31 
 
 
516 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.76 
 
 
429 aa  176  6e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.93 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.24 
 
 
434 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0421  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.35 
 
 
439 aa  170  3e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  29.44 
 
 
438 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30 
 
 
438 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0832  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.37 
 
 
471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.14 
 
 
438 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0367  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.93 
 
 
440 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.313304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  28.54 
 
 
466 aa  163  6e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1353  RNA modification protein  32.33 
 
 
450 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.707059  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.26 
 
 
442 aa  162  1e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.75 
 
 
439 aa  161  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3872  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.44 
 
 
436 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  28.64 
 
 
447 aa  160  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2979  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.66 
 
 
459 aa  159  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122351  hitchhiker  0.00203806 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2139  RNA modification enzyme, MiaB family  31.57 
 
 
450 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3701  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.4 
 
 
445 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3617  RNA modification protein  32.98 
 
 
467 aa  158  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2062  RNA modification enzyme, MiaB family  27.78 
 
 
482 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.73 
 
 
450 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0697  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.66 
 
 
462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.224906 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.66 
 
 
421 aa  156  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.05 
 
 
473 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1076  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.16 
 
 
441 aa  156  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0452  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.53 
 
 
463 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1220  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.05 
 
 
474 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.0448145 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0468  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.05 
 
 
473 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1155  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.62 
 
 
474 aa  155  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.98 
 
 
409 aa  155  2e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0065  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.16 
 
 
451 aa  154  2e-36  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.09 
 
 
462 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.69 
 
 
471 aa  155  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0811  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.09 
 
 
494 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0252  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.74 
 
 
441 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0237  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.15 
 
 
446 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.956041  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.21 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000298883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.41 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3919  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.65 
 
 
475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0235  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.75 
 
 
447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  31.43 
 
 
437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  28.86 
 
 
478 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2173  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.38 
 
 
442 aa  153  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  28.89 
 
 
445 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3399  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.33 
 
 
446 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.497739  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.69 
 
 
477 aa  153  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.58 
 
 
441 aa  153  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.83 
 
 
438 aa  152  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.79 
 
 
456 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2066  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.73 
 
 
467 aa  152  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0928241  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3204  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.12 
 
 
446 aa  152  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  30.99 
 
 
450 aa  152  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.24 
 
 
437 aa  152  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2153  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.73 
 
 
467 aa  152  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.79 
 
 
456 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1591  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.93 
 
 
445 aa  151  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.712664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.79 
 
 
510 aa  151  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3033  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.62 
 
 
456 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  28.79 
 
 
480 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1829  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.82 
 
 
482 aa  150  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.59 
 
 
451 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3528  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.22 
 
 
462 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1999  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.81 
 
 
441 aa  151  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2915  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.57 
 
 
474 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000321738  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.55 
 
 
409 aa  150  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2064  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.17 
 
 
444 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3005  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.57 
 
 
509 aa  150  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.33 
 
 
512 aa  150  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000618798  normal  0.207012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.89 
 
 
446 aa  150  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1019  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.04 
 
 
437 aa  150  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00413042  normal  0.658978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.75 
 
 
450 aa  149  6e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>