More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0373 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
411 aa  843    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.9 
 
 
430 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.84 
 
 
420 aa  291  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  39.23 
 
 
418 aa  286  5e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.64 
 
 
404 aa  285  9e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.77 
 
 
374 aa  280  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  36.25 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.15 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.02 
 
 
421 aa  268  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.61 
 
 
428 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  39.18 
 
 
416 aa  266  4e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.98 
 
 
422 aa  264  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.25 
 
 
417 aa  262  8e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40 
 
 
417 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.17 
 
 
424 aa  260  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.47 
 
 
430 aa  258  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.65 
 
 
425 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.41 
 
 
425 aa  256  6e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  35.47 
 
 
442 aa  255  9e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.3 
 
 
420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.41 
 
 
425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  35.49 
 
 
428 aa  234  3e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.43 
 
 
449 aa  232  9e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  34.88 
 
 
422 aa  228  2e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  35.13 
 
 
415 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  31.75 
 
 
516 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  35.63 
 
 
440 aa  204  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  35.06 
 
 
416 aa  203  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  35.06 
 
 
415 aa  203  6e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0851  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.3 
 
 
435 aa  202  7e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.154283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.51 
 
 
471 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.03 
 
 
429 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  33.18 
 
 
433 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.77 
 
 
471 aa  192  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  32.78 
 
 
438 aa  192  9e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.25 
 
 
494 aa  192  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3911  RNA modification enzyme, MiaB family  30.98 
 
 
483 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1442  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.47 
 
 
499 aa  187  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0454  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.82 
 
 
430 aa  186  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000369122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  31.77 
 
 
480 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1464  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.3 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000457161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.46 
 
 
512 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000618798  normal  0.207012 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  30.95 
 
 
446 aa  183  6e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3986  RNA modification enzyme, MiaB family  31.01 
 
 
508 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219223  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1044  RNA modification enzyme, MiaB family  29.31 
 
 
534 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.852588  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  31.82 
 
 
447 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1462  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.75 
 
 
522 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  31.62 
 
 
435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.64 
 
 
434 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.14 
 
 
421 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2599  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.57 
 
 
487 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000474817  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23170  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.7 
 
 
557 aa  180  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.144121 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.37 
 
 
434 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  30.39 
 
 
444 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  28.67 
 
 
434 aa  179  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2225  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.68 
 
 
502 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550449  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.97 
 
 
437 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  29.38 
 
 
450 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07250  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.65 
 
 
515 aa  178  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.673906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.47 
 
 
531 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2979  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.68 
 
 
459 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122351  hitchhiker  0.00203806 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1400  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.8 
 
 
502 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00158929 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3249  RNA modification enzyme, MiaB family  30.91 
 
 
443 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4167  RNA modification enzyme, MiaB family  30.23 
 
 
495 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.86 
 
 
443 aa  176  8e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.48 
 
 
438 aa  176  8e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.86 
 
 
443 aa  176  8e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.84 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.84 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15041  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.33 
 
 
464 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1444  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.84 
 
 
491 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3285  RNA modification enzyme, MiaB family  31.2 
 
 
497 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0343128  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17251  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.99 
 
 
463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1484  RNA modification enzyme, MiaB family  29.46 
 
 
497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1401  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.51 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1591  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.44 
 
 
445 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.712664 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0871  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.76 
 
 
463 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14911  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.31 
 
 
464 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2442  RNA modification enzyme, MiaB family  29.82 
 
 
549 aa  173  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26941  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.2 
 
 
447 aa  173  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  31.03 
 
 
445 aa  173  5.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1076  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.75 
 
 
441 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1499  RNA modification enzyme, MiaB family  31.07 
 
 
510 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353908  normal  0.351576 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1488  RNA modification protein  30.37 
 
 
497 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  29.06 
 
 
450 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  28.15 
 
 
449 aa  172  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  29.06 
 
 
450 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1617  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.02 
 
 
509 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00553824  normal  0.0299379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2157  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.93 
 
 
525 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  31.09 
 
 
478 aa  172  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3847  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.24 
 
 
496 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2203  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.93 
 
 
529 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.34 
 
 
523 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2144  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.4 
 
 
526 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00154343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0811  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.23 
 
 
494 aa  170  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3967  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.29 
 
 
512 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  28.83 
 
 
450 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  28.83 
 
 
450 aa  170  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0972  2-methylthioadenine synthetase  30.48 
 
 
445 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  31.63 
 
 
434 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>