More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1188 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
449 aa  908    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.38 
 
 
425 aa  478  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.4 
 
 
421 aa  475  1e-133  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  53.48 
 
 
425 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  53.93 
 
 
425 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  35.63 
 
 
418 aa  276  6e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  36.08 
 
 
421 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.16 
 
 
422 aa  254  3e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.06 
 
 
430 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.82 
 
 
404 aa  236  7e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.43 
 
 
411 aa  232  1e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.72 
 
 
430 aa  227  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  31.82 
 
 
442 aa  226  9e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  32.03 
 
 
415 aa  225  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  31.32 
 
 
416 aa  223  4e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.02 
 
 
434 aa  220  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.31 
 
 
420 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  29.5 
 
 
415 aa  218  2e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  29.36 
 
 
416 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.48 
 
 
417 aa  218  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  30.07 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.63 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.2 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  29.07 
 
 
428 aa  209  6e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.12 
 
 
424 aa  207  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  27.97 
 
 
440 aa  207  4e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.97 
 
 
420 aa  207  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  31.59 
 
 
450 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  30.48 
 
 
438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.2 
 
 
471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  27.97 
 
 
516 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.91 
 
 
471 aa  195  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1012  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.81 
 
 
463 aa  189  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  28.35 
 
 
445 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2062  RNA modification enzyme, MiaB family  26.62 
 
 
482 aa  187  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2424  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.07 
 
 
509 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  30.57 
 
 
434 aa  186  7e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  29.04 
 
 
449 aa  186  8e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3871  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.98 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1428  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.76 
 
 
509 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3543  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.54 
 
 
509 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0128705  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.14 
 
 
444 aa  182  1e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.37 
 
 
531 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.29 
 
 
523 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761282  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0421  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.14 
 
 
439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  30.27 
 
 
446 aa  180  4e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.71 
 
 
428 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  27.37 
 
 
433 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.04 
 
 
451 aa  179  9e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3621  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.32 
 
 
509 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3908  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.32 
 
 
509 aa  179  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.41 
 
 
450 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3784  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.1 
 
 
509 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0126107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0185  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.52 
 
 
440 aa  178  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3513  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.89 
 
 
509 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.89 
 
 
509 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0252  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.85 
 
 
441 aa  176  5e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.23 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3806  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.67 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3819  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.67 
 
 
509 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.28 
 
 
430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.69 
 
 
447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.76 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.87 
 
 
456 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000213731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  27.29 
 
 
480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2374  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.37 
 
 
452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.997714 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14552  predicted protein  28.14 
 
 
453 aa  174  3.9999999999999995e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.57073  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.41 
 
 
443 aa  173  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.41 
 
 
443 aa  173  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.38 
 
 
477 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  29.46 
 
 
434 aa  172  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0639  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.89 
 
 
445 aa  172  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  27.25 
 
 
442 aa  171  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000009336  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0972  2-methylthioadenine synthetase  27.1 
 
 
445 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3617  RNA modification protein  26.77 
 
 
467 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  26.04 
 
 
447 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09080  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.05 
 
 
442 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370572  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1591  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.31 
 
 
445 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.712664 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29 
 
 
439 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  27.19 
 
 
478 aa  170  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  27.46 
 
 
482 aa  170  4e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0860  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.51 
 
 
514 aa  170  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116218  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.43 
 
 
442 aa  170  5e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0468  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.22 
 
 
473 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0242  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.79 
 
 
473 aa  170  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0614  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.11 
 
 
486 aa  169  8e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.49 
 
 
438 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0040  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.84 
 
 
472 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000523218 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0454  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.49 
 
 
430 aa  169  9e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000369122  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1352  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.14 
 
 
514 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1378  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.14 
 
 
514 aa  169  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.5 
 
 
429 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12350  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.23 
 
 
446 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.58 
 
 
510 aa  169  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3787  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.98 
 
 
446 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.453305  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.98 
 
 
473 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.97 
 
 
473 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0287805  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.84 
 
 
427 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1076  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.96 
 
 
441 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0851  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.5 
 
 
435 aa  168  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.154283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>