More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1400 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  77.59 
 
 
425 aa  679    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
421 aa  855    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  77.12 
 
 
425 aa  676    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  77.36 
 
 
425 aa  681    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  54.4 
 
 
449 aa  475  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  37.35 
 
 
421 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  37.32 
 
 
418 aa  281  2e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.02 
 
 
411 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.65 
 
 
404 aa  260  3e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.07 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  30.21 
 
 
422 aa  243  5e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.12 
 
 
430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  31.64 
 
 
415 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.72 
 
 
430 aa  229  9e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  30.5 
 
 
415 aa  227  2e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  31.55 
 
 
428 aa  226  6e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  31.35 
 
 
416 aa  226  7e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.52 
 
 
434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.83 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  32.41 
 
 
442 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.59 
 
 
424 aa  219  1e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.32 
 
 
420 aa  218  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  29.51 
 
 
440 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.59 
 
 
374 aa  210  4e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.02 
 
 
417 aa  209  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.78 
 
 
417 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  29.62 
 
 
416 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.6 
 
 
428 aa  192  1e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  28.5 
 
 
516 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  30.37 
 
 
438 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1012  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.73 
 
 
463 aa  187  3e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  30.7 
 
 
450 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2424  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.08 
 
 
509 aa  187  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.56 
 
 
523 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.39 
 
 
531 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.6 
 
 
439 aa  184  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2062  RNA modification enzyme, MiaB family  26.64 
 
 
482 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  30.11 
 
 
434 aa  182  8.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.8 
 
 
444 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0832  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.08 
 
 
471 aa  181  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.58 
 
 
430 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3871  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.18 
 
 
509 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3784  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.95 
 
 
509 aa  180  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0126107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3621  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.73 
 
 
509 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3908  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.73 
 
 
509 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3543  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.25 
 
 
509 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0128705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1428  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.95 
 
 
509 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3513  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.73 
 
 
509 aa  179  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.73 
 
 
509 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.56 
 
 
471 aa  179  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  28.93 
 
 
445 aa  179  9e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1323  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.17 
 
 
482 aa  179  9e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0560356  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4999  MiaB family RNA modification protein  29.27 
 
 
453 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3037  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.51 
 
 
454 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  27.49 
 
 
482 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3806  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.5 
 
 
509 aa  177  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  30.96 
 
 
449 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  28.8 
 
 
451 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3819  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.5 
 
 
509 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1128  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.77 
 
 
446 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.25 
 
 
471 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12350  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.7 
 
 
446 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5916  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.73 
 
 
473 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00612207  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.41 
 
 
435 aa  176  6e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2374  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.94 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.997714 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.97 
 
 
442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1484  RNA modification enzyme, MiaB family  28.22 
 
 
497 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.77 
 
 
447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1352  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.23 
 
 
514 aa  173  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1378  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.23 
 
 
514 aa  173  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4345  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.38 
 
 
442 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0252  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.87 
 
 
441 aa  172  1e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  30.68 
 
 
446 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0185  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.02 
 
 
440 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0614  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.85 
 
 
486 aa  171  2e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18877  predicted protein  27.77 
 
 
455 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1288  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.86 
 
 
431 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  27.94 
 
 
442 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000009336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  29.66 
 
 
480 aa  170  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4804  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.54 
 
 
442 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557764  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0860  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.25 
 
 
514 aa  169  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.116218  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1821  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.67 
 
 
481 aa  169  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0513029 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.57 
 
 
443 aa  168  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.31 
 
 
456 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000213731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.57 
 
 
443 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0326  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.38 
 
 
432 aa  168  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.53 
 
 
409 aa  168  2e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1850  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.05 
 
 
481 aa  168  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  26.1 
 
 
433 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  30.21 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0106  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.46 
 
 
454 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.027127 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1353  RNA modification protein  25.17 
 
 
450 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.707059  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0972  2-methylthioadenine synthetase  29.32 
 
 
445 aa  166  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  29.44 
 
 
451 aa  166  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  31.5 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  31.07 
 
 
450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0377  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.38 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.115898  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  31.5 
 
 
448 aa  165  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3779  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.64 
 
 
459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  30.84 
 
 
450 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>