More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1353 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
430 aa  888    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  58.2 
 
 
442 aa  535  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.49 
 
 
422 aa  309  5e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.42 
 
 
420 aa  268  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.43 
 
 
430 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.47 
 
 
411 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.06 
 
 
449 aa  251  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  33.33 
 
 
418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  32.24 
 
 
421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  34.11 
 
 
416 aa  238  1e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  32.64 
 
 
428 aa  233  5e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.03 
 
 
434 aa  231  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.18 
 
 
404 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.72 
 
 
421 aa  229  9e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.12 
 
 
425 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.11 
 
 
425 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.71 
 
 
417 aa  224  3e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.1 
 
 
424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.73 
 
 
425 aa  222  8e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  30.18 
 
 
422 aa  222  9e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.68 
 
 
420 aa  222  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.71 
 
 
417 aa  220  3e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  32.19 
 
 
516 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.97 
 
 
374 aa  207  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  30.47 
 
 
415 aa  194  3e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0454  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.48 
 
 
430 aa  193  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000369122  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.62 
 
 
428 aa  192  7e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  29.41 
 
 
415 aa  191  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  29.21 
 
 
450 aa  189  9e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  34.64 
 
 
446 aa  186  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  32.83 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.46 
 
 
440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000298883  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.75 
 
 
477 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2062  RNA modification enzyme, MiaB family  29.37 
 
 
482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  31.22 
 
 
444 aa  181  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.09 
 
 
434 aa  180  4e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0590  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.64 
 
 
468 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.632056  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  30.41 
 
 
449 aa  178  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0242  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.97 
 
 
473 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.71 
 
 
429 aa  177  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  28 
 
 
416 aa  177  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.23 
 
 
435 aa  177  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0468  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.36 
 
 
473 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.4 
 
 
427 aa  177  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2374  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.4 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.997714 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0582  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.83 
 
 
444 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362329  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.07 
 
 
434 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0678  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.48 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000258003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  29.62 
 
 
442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000009336  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  27.54 
 
 
440 aa  173  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.15 
 
 
462 aa  172  9e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  30.3 
 
 
447 aa  172  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4821  RNA modification enzyme, MiaB family  28.48 
 
 
521 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.96 
 
 
473 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0287805  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0185  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.92 
 
 
440 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1591  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.41 
 
 
445 aa  171  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.712664 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19921  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.18 
 
 
480 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.135238 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.93 
 
 
443 aa  170  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.93 
 
 
443 aa  170  4e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.55 
 
 
447 aa  170  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  28.83 
 
 
445 aa  170  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0208  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.19 
 
 
449 aa  170  5e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  29.1 
 
 
433 aa  169  8e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  30.54 
 
 
438 aa  169  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0419  RNA modification protein  30.48 
 
 
456 aa  168  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.752325  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3205  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.29 
 
 
447 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2153  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.25 
 
 
467 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2066  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.25 
 
 
467 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0928241  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1467  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.57 
 
 
444 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.369998  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.89 
 
 
471 aa  168  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.75 
 
 
430 aa  167  4e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3127  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.3 
 
 
440 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00194876  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.33 
 
 
409 aa  167  4e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.57 
 
 
430 aa  167  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3701  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.19 
 
 
445 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0470  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.6 
 
 
438 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1499  RNA modification enzyme, MiaB family  28.87 
 
 
510 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353908  normal  0.351576 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1323  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.22 
 
 
482 aa  166  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0560356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11970  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.38 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000060077  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  28.83 
 
 
437 aa  166  8e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0237  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.55 
 
 
446 aa  166  8e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.956041  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0761  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.54 
 
 
441 aa  166  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.206717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3110  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.65 
 
 
446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000143108  normal  0.954122 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0832  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  30.23 
 
 
471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0851  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.62 
 
 
435 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.154283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0777  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.81 
 
 
441 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.99 
 
 
430 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1353  RNA modification protein  29.17 
 
 
450 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.707059  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  30.49 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1929  putative tRNA modifying protein  32.17 
 
 
445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1647  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  32.17 
 
 
445 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3787  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.13 
 
 
446 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.453305  normal  0.448249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  26.94 
 
 
482 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.08 
 
 
494 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2173  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.64 
 
 
442 aa  164  3e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  29.24 
 
 
443 aa  164  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.57 
 
 
471 aa  164  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.71 
 
 
510 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3285  RNA modification enzyme, MiaB family  29.75 
 
 
497 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0343128  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3199  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  29.36 
 
 
449 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>