More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1835 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  100 
 
 
442 aa  918    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  58.2 
 
 
430 aa  535  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.34 
 
 
422 aa  296  6e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.88 
 
 
430 aa  269  7e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.73 
 
 
420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.47 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  32.72 
 
 
416 aa  238  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  31.13 
 
 
421 aa  234  3e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  31.75 
 
 
418 aa  233  7.000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.98 
 
 
425 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.65 
 
 
404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  31.28 
 
 
428 aa  226  8e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.82 
 
 
449 aa  226  9e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.06 
 
 
425 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.19 
 
 
374 aa  223  6e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.41 
 
 
421 aa  220  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.16 
 
 
425 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  29.68 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.8 
 
 
434 aa  212  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.52 
 
 
417 aa  211  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.82 
 
 
417 aa  209  6e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  29.36 
 
 
516 aa  209  8e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  31.7 
 
 
415 aa  209  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  32.51 
 
 
415 aa  207  3e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.43 
 
 
424 aa  206  7e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  30.99 
 
 
416 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.65 
 
 
428 aa  200  5e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.84 
 
 
420 aa  199  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  30.27 
 
 
440 aa  188  2e-46  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.69 
 
 
434 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.7 
 
 
434 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  29.95 
 
 
446 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.64 
 
 
443 aa  166  8e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.64 
 
 
443 aa  166  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  28.7 
 
 
434 aa  163  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1499  RNA modification enzyme, MiaB family  28.22 
 
 
510 aa  162  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.353908  normal  0.351576 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  29.16 
 
 
427 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.57 
 
 
421 aa  162  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.98 
 
 
456 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000213731  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1126  RNA modification enzyme, MiaB family  28.8 
 
 
498 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.152037 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1353  RNA modification protein  27.01 
 
 
450 aa  160  5e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.707059  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.32 
 
 
429 aa  159  8e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.19 
 
 
471 aa  159  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4821  RNA modification enzyme, MiaB family  27 
 
 
521 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18877  predicted protein  30 
 
 
455 aa  158  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  27.59 
 
 
450 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.42 
 
 
471 aa  158  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1488  RNA modification protein  28.7 
 
 
497 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4167  RNA modification enzyme, MiaB family  29.28 
 
 
495 aa  157  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  28.51 
 
 
466 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1484  RNA modification enzyme, MiaB family  27.19 
 
 
497 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.35 
 
 
439 aa  156  6e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0776  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.11 
 
 
474 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.410569  normal  0.687788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0788  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.11 
 
 
474 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0715  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.11 
 
 
474 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188507  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0824  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.11 
 
 
474 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0729  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.11 
 
 
474 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  26.8 
 
 
447 aa  155  9e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1711  hypothetical protein  30.87 
 
 
436 aa  155  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0678  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.1 
 
 
446 aa  155  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000258003  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3872  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.3 
 
 
436 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.91 
 
 
438 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.74 
 
 
430 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0982  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.27 
 
 
443 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.423682  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.71 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1262  2-methylthioadenine synthetase  25.33 
 
 
439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.467346  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.47 
 
 
450 aa  154  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.29 
 
 
434 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.1 
 
 
510 aa  154  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.44 
 
 
438 aa  153  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.22 
 
 
494 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.751852 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3005  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.68 
 
 
509 aa  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187543  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19921  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.2 
 
 
480 aa  153  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.135238 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2374  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.21 
 
 
452 aa  152  8e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.997714 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1829  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.9 
 
 
482 aa  152  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2706  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.64 
 
 
461 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.878988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0412  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.75 
 
 
456 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.259643 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0586  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.44 
 
 
474 aa  152  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0067501  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.03 
 
 
434 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0893  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.81 
 
 
474 aa  152  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188426  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00629  isopentenyl-adenosine A37 tRNA methylthiolase  26.44 
 
 
474 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.194806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2965  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  26.44 
 
 
474 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00048321  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0871  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.54 
 
 
463 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.38 
 
 
441 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0755  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.44 
 
 
474 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00437825  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2915  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.68 
 
 
474 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000321738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0684  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.44 
 
 
474 aa  152  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00591488  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00620  hypothetical protein  26.44 
 
 
474 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0708  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.44 
 
 
474 aa  152  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000784837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0690  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.44 
 
 
474 aa  152  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2984  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.44 
 
 
474 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0263155  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.44 
 
 
446 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.49 
 
 
477 aa  151  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3182  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.17 
 
 
447 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155931  normal  0.0201229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3205  hypothetical protein  26.81 
 
 
445 aa  150  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000023464  hitchhiker  3.0015199999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  27.59 
 
 
451 aa  150  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.3 
 
 
449 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0748  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.23 
 
 
451 aa  150  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000201593 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.3 
 
 
417 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>