More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1521 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  74.11 
 
 
417 aa  645    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
420 aa  866    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  74.29 
 
 
424 aa  650    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  74.11 
 
 
417 aa  648    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  75.89 
 
 
434 aa  658    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.3 
 
 
411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  36.45 
 
 
416 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.76 
 
 
430 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  33.41 
 
 
421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.24 
 
 
374 aa  240  4e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.26 
 
 
420 aa  238  2e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  35.46 
 
 
404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.24 
 
 
422 aa  232  9e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  33.33 
 
 
418 aa  229  7e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  37.32 
 
 
415 aa  225  1e-57  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  34.89 
 
 
415 aa  224  2e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  35.9 
 
 
416 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.68 
 
 
430 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.32 
 
 
421 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  34.73 
 
 
440 aa  217  4e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.4 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  33.72 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.08 
 
 
425 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.22 
 
 
428 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.84 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.97 
 
 
449 aa  207  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  31.12 
 
 
422 aa  204  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  29.84 
 
 
442 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.39 
 
 
434 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  29.55 
 
 
516 aa  182  1e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2064  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.68 
 
 
444 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1591  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.32 
 
 
445 aa  177  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.712664 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.93 
 
 
434 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.96 
 
 
429 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1155  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.07 
 
 
474 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2062  RNA modification enzyme, MiaB family  29.78 
 
 
482 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.98 
 
 
438 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0031  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.89 
 
 
473 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0851  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.19 
 
 
435 aa  169  7e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.154283  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  30.62 
 
 
466 aa  168  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.38 
 
 
462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0019  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.31 
 
 
469 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.43689 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  26.98 
 
 
449 aa  166  9e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  33.24 
 
 
437 aa  166  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  28.77 
 
 
473 aa  166  9e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  30.08 
 
 
434 aa  166  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.07 
 
 
421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0832  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.84 
 
 
471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  28.64 
 
 
447 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.5 
 
 
438 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0421  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.7 
 
 
439 aa  164  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2153  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.71 
 
 
467 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2066  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.71 
 
 
467 aa  164  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0928241  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1220  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.64 
 
 
474 aa  162  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.0448145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3134  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.86 
 
 
474 aa  162  8.000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4821  RNA modification enzyme, MiaB family  30.08 
 
 
521 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.95 
 
 
510 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1829  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.75 
 
 
482 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0065  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  31.32 
 
 
451 aa  161  2e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  29.06 
 
 
436 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.13 
 
 
437 aa  162  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2915  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.61 
 
 
474 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000321738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3005  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.52 
 
 
509 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187543  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.04 
 
 
446 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.18 
 
 
471 aa  160  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0748  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.96 
 
 
451 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000201593 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0596  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.96 
 
 
451 aa  160  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3033  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30 
 
 
456 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2948  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.23 
 
 
476 aa  159  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.03 
 
 
442 aa  159  8e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1076  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.76 
 
 
441 aa  159  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1108  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.63 
 
 
476 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3617  RNA modification protein  29.56 
 
 
467 aa  159  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0452  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.49 
 
 
463 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2455  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.43 
 
 
440 aa  159  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000298883  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3872  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.77 
 
 
436 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0014  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.64 
 
 
477 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.581004  normal  0.0355743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  31.03 
 
 
444 aa  158  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3300  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.42 
 
 
454 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2979  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.05 
 
 
459 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122351  hitchhiker  0.00203806 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3701  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.25 
 
 
445 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  27.54 
 
 
450 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3919  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.37 
 
 
475 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  29.55 
 
 
450 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0697  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.31 
 
 
462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.224906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1197  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  30.61 
 
 
474 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  29.55 
 
 
450 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0242  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.22 
 
 
473 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1462  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30 
 
 
522 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3127  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.75 
 
 
440 aa  156  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00194876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3572  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.77 
 
 
480 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  29.55 
 
 
450 aa  155  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  29.32 
 
 
450 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.14 
 
 
443 aa  155  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004211  tRNA-i(6)A37 methylthiotransferase  30.23 
 
 
474 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000336793  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.12 
 
 
473 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0287805  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.95 
 
 
439 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0437  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.99 
 
 
477 aa  155  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  29.32 
 
 
450 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1243  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.44 
 
 
458 aa  155  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>