More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2995 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1521  MiaB-like tRNA modifying enzyme  74.29 
 
 
420 aa  650    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  100 
 
 
424 aa  867    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  69.71 
 
 
434 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0557  MiaB-like tRNA modifying enzyme  69.14 
 
 
417 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2951  MiaB-like tRNA modifying enzyme  68.9 
 
 
417 aa  593  1e-168  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.66 
 
 
430 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.17 
 
 
411 aa  260  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2762  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.54 
 
 
420 aa  254  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0580  hypothetical protein  35.56 
 
 
416 aa  250  4e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0109764  hitchhiker  0.000964541 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.89 
 
 
374 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.17 
 
 
422 aa  239  6.999999999999999e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0189  RNA modification enzyme, MiaB family  32.37 
 
 
421 aa  233  5e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.54 
 
 
404 aa  231  2e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  32.53 
 
 
418 aa  231  2e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1353  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.1 
 
 
430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1003  RNA modification protein  33.03 
 
 
422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1400  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.59 
 
 
421 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.99776  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  33.18 
 
 
415 aa  212  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.17 
 
 
428 aa  211  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30 
 
 
425 aa  210  3e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  34.42 
 
 
428 aa  209  8e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30 
 
 
425 aa  207  3e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  33.96 
 
 
416 aa  207  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.12 
 
 
449 aa  207  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  30.43 
 
 
442 aa  206  6e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1780  RNA modification protein  34.91 
 
 
415 aa  206  7e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1160  RNA modification protein  33.33 
 
 
440 aa  204  3e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.53 
 
 
425 aa  202  9e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.54 
 
 
434 aa  187  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  30.81 
 
 
516 aa  183  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.69 
 
 
434 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0019  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.49 
 
 
469 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.43689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.51 
 
 
462 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2066  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.07 
 
 
467 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0928241  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.55 
 
 
421 aa  176  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  31.47 
 
 
436 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2153  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.07 
 
 
467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1155  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.13 
 
 
474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0031  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.98 
 
 
473 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.92 
 
 
429 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  27.11 
 
 
449 aa  170  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0252  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.27 
 
 
441 aa  170  5e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1591  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.38 
 
 
445 aa  169  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.712664 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0832  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28 
 
 
471 aa  167  2e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.24 
 
 
473 aa  168  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1214  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.74 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193659  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.54 
 
 
442 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2064  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.31 
 
 
444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  30.59 
 
 
466 aa  164  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0815  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.24 
 
 
474 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.518206  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1076  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.78 
 
 
441 aa  163  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.96 
 
 
440 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2575  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.82 
 
 
483 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.687203  normal  0.0756163 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3617  RNA modification protein  31.38 
 
 
467 aa  162  9e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0421  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.5 
 
 
439 aa  162  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1294  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.44 
 
 
409 aa  162  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1220  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.2 
 
 
474 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.0448145 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  28.7 
 
 
448 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  28.7 
 
 
448 aa  161  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1181  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.33 
 
 
474 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.48 
 
 
409 aa  160  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0065  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.03 
 
 
451 aa  160  3e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2855  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.54 
 
 
474 aa  160  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0713  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.76 
 
 
474 aa  160  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124358  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3701  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.98 
 
 
445 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.592545 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0021  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.63 
 
 
450 aa  160  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0814495  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1357  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.49 
 
 
472 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245853  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  28.89 
 
 
438 aa  160  5e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0651  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  29.86 
 
 
442 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.07 
 
 
456 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0437  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.72 
 
 
477 aa  159  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.809757  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1859  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.75 
 
 
448 aa  159  6e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.78 
 
 
432 aa  159  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1004  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.11 
 
 
474 aa  159  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0127887  normal  0.185455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3261  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.99 
 
 
474 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.803494  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3919  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.91 
 
 
475 aa  159  8e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  29.09 
 
 
449 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1106  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.76 
 
 
474 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000160035 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  29.09 
 
 
451 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0040  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.82 
 
 
472 aa  159  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000523218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3127  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.67 
 
 
440 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00194876  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30 
 
 
456 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3439  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.76 
 
 
474 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  29.48 
 
 
445 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  27.59 
 
 
434 aa  158  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2706  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.29 
 
 
461 aa  158  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.878988 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.36 
 
 
438 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3303  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.76 
 
 
474 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668925  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2062  RNA modification enzyme, MiaB family  28.35 
 
 
482 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1069  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.11 
 
 
474 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.149262  normal  0.025726 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  28.64 
 
 
450 aa  158  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.86 
 
 
510 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1008  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.89 
 
 
474 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal  0.0977371 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2292  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.43 
 
 
453 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.67 
 
 
450 aa  157  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3528  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.67 
 
 
462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3471  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.37 
 
 
474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000111434  normal  0.160126 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.12 
 
 
471 aa  156  6e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.58 
 
 
441 aa  156  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0697  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.63 
 
 
462 aa  156  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.224906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>