39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0756 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  60.73 
 
 
553 aa  700    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  60.44 
 
 
547 aa  661    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  61.54 
 
 
550 aa  676    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  100 
 
 
551 aa  1116    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  56.2 
 
 
557 aa  610  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  45.29 
 
 
566 aa  484  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  45.09 
 
 
575 aa  479  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  44.36 
 
 
551 aa  442  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  44.18 
 
 
551 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  42.05 
 
 
625 aa  428  1e-118  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 
572 aa  416  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 
575 aa  409  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  41.25 
 
 
556 aa  412  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 
595 aa  410  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 
590 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  43.48 
 
 
565 aa  401  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  43.3 
 
 
565 aa  396  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 
556 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  41.85 
 
 
565 aa  391  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  39.05 
 
 
542 aa  389  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  40.77 
 
 
532 aa  383  1e-105  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  41.08 
 
 
565 aa  370  1e-101  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 
510 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  40.43 
 
 
510 aa  367  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  39.58 
 
 
517 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 
510 aa  365  2e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 
509 aa  364  3e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  39.96 
 
 
535 aa  362  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  42.17 
 
 
567 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  38.05 
 
 
515 aa  335  1e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 
497 aa  60.8  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1467  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  22.99 
 
 
444 aa  53.9  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.369998  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.89 
 
 
479 aa  49.3  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 
412 aa  48.1  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3359  Radical SAM domain protein  25 
 
 
539 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 
398 aa  47  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  26.38 
 
 
495 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 
435 aa  45.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
515 aa  44.3  0.006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>