70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0640 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  73.98 
 
 		 595 aa  881    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  75.83 
 
 		 575 aa  888    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  75.3 
 
 		 572 aa  880    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  73.3 
 
 		 590 aa  855    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 625 aa  1262    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  45.47 
 
 		 575 aa  482  1e-135  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  43.43 
 
 		 566 aa  475  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 565 aa  431  1e-119  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  42.05 
 
 		 551 aa  428  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  43.01 
 
 		 553 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  41.84 
 
 		 565 aa  415  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  39.38 
 
 		 556 aa  412  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  42.36 
 
 		 551 aa  412  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  39.93 
 
 		 565 aa  411  1e-113  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  41.79 
 
 		 557 aa  410  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  41.03 
 
 		 550 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  42.18 
 
 		 551 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  40.18 
 
 		 542 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  44.21 
 
 		 547 aa  405  1e-111  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  37.95 
 
 		 532 aa  398  1e-109  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  41.86 
 
 		 556 aa  397  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  40.79 
 
 		 565 aa  396  1e-109  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 		 567 aa  364  2e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 517 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 		 510 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  40.26 
 
 		 535 aa  360  5e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  38.32 
 
 		 510 aa  360  6e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  38.09 
 
 		 509 aa  359  7e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  38.13 
 
 		 510 aa  359  8e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 		 515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  32.56 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 410 aa  56.6  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 412 aa  56.6  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  29.29 
 
 		 542 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 		 393 aa  53.5  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 497 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.67 
 
 		 420 aa  49.7  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 547 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01161  Fe-S oxidoreductase  30.34 
 
 		 462 aa  48.5  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 451 aa  48.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 426 aa  47.8  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0959  radical SAM family protein  30.36 
 
 		 530 aa  47.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  25.85 
 
 		 482 aa  47.4  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26767  predicted protein  33.71 
 
 		 450 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.071035 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3079  radical SAM family protein  29.46 
 
 		 530 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  27.45 
 
 		 543 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  25.76 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.84 
 
 		 449 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  37.84 
 
 		 449 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 529 aa  46.6  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 531 aa  46.2  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3120  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.84 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  26.47 
 
 		 528 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1715  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.37 
 
 		 531 aa  45.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1536  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.37 
 
 		 525 aa  45.1  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262193 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.62 
 
 		 465 aa  45.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  28.22 
 
 		 529 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.15 
 
 		 420 aa  44.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1944  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.54 
 
 		 437 aa  44.7  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  21.18 
 
 		 438 aa  44.7  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1673  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.54 
 
 		 442 aa  44.3  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.93 
 
 		 422 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0393  Radical SAM domain protein  47.5 
 
 		 397 aa  44.3  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00226682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.17 
 
 		 441 aa  44.3  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31.31 
 
 		 419 aa  44.3  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 494 aa  44.3  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0470  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  41.18 
 
 		 438 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1821  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.45 
 
 		 481 aa  43.9  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0513029 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1614  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  38.96 
 
 		 471 aa  43.9  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0719193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 467 aa  43.9  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>