299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0018 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 497 aa  1016    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 		 497 aa  339  7e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 		 515 aa  298  1e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 526 aa  281  2e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  35.7 
 
 		 546 aa  269  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  33.86 
 
 		 503 aa  263  6.999999999999999e-69  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  37.06 
 
 		 503 aa  261  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  33.59 
 
 		 531 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 		 531 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 		 530 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 		 530 aa  247  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  35.01 
 
 		 532 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 548 aa  243  7e-63  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 531 aa  241  2e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  30.55 
 
 		 528 aa  238  3e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  33.56 
 
 		 524 aa  210  5e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 502 aa  207  3e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 574 aa  178  2e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 369 aa  96.3  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 		 369 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 369 aa  87  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  24.29 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 398 aa  83.6  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 412 aa  82  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  28.67 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 372 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  25.56 
 
 		 377 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  24.53 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  23.35 
 
 		 360 aa  66.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  23.02 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  25.37 
 
 		 551 aa  60.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.87 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  24.13 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.67 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 		 597 aa  57.4  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  22.57 
 
 		 378 aa  57  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  24.17 
 
 		 441 aa  57  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  21.94 
 
 		 470 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  26.7 
 
 		 444 aa  56.2  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 551 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 438 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.83 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.83 
 
 		 447 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 397 aa  56.6  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10770  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  21.75 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.46991  unclonable  0.00000000221813 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 551 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004211  tRNA-i(6)A37 methylthiotransferase  25 
 
 		 474 aa  55.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000336793  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  21.64 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 450 aa  55.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.41 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  23.49 
 
 		 430 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01230  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.47 
 
 		 474 aa  54.7  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  21.84 
 
 		 503 aa  54.3  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  22.07 
 
 		 445 aa  54.3  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1400  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.44 
 
 		 502 aa  54.3  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158929 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  28.87 
 
 		 842 aa  53.9  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  27.35 
 
 		 437 aa  53.9  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.86 
 
 		 427 aa  53.9  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 564 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  25.37 
 
 		 566 aa  53.5  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 550 aa  53.5  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1108  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24 
 
 		 476 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 564 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1442  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.44 
 
 		 499 aa  53.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07430  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  25.57 
 
 		 448 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000348325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  23.18 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.68 
 
 		 554 aa  52.4  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1829  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.5 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  21.31 
 
 		 484 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2915  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.92 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000321738  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.43 
 
 		 430 aa  52.8  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  27.09 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.7 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 		 441 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2948  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  23.73 
 
 		 476 aa  52  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0869387  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0484  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.97 
 
 		 474 aa  51.6  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3005  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.33 
 
 		 509 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187543  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2575  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 483 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.687203  normal  0.0756163 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  24.26 
 
 		 480 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  24.61 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.13 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0811  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.17 
 
 		 494 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0632  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.6 
 
 		 448 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.3058599999999997e-35 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0713  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.64 
 
 		 474 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124358  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 		 556 aa  51.6  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0618  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.91 
 
 		 448 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000754849  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  23.15 
 
 		 438 aa  50.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0996  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.75 
 
 		 474 aa  50.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  22.36 
 
 		 533 aa  50.8  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  21.18 
 
 		 501 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>