42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2101 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  100 
 
 		 575 aa  1169    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  61.26 
 
 		 566 aa  736    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  45.41 
 
 		 590 aa  504  1e-141  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  48.94 
 
 		 553 aa  492  9.999999999999999e-139  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  45.38 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  45.49 
 
 		 595 aa  491  1e-137  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  45.47 
 
 		 625 aa  482  1e-135  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  44.94 
 
 		 575 aa  483  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  45.09 
 
 		 551 aa  479  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  49.82 
 
 		 547 aa  481  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  44.71 
 
 		 542 aa  462  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  43.94 
 
 		 556 aa  459  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  46.26 
 
 		 557 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  42.83 
 
 		 565 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  45.7 
 
 		 517 aa  444  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  44.41 
 
 		 565 aa  445  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  45.45 
 
 		 550 aa  444  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  42.31 
 
 		 565 aa  442  1e-123  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 		 551 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  46.17 
 
 		 510 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  46.55 
 
 		 510 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  42.38 
 
 		 551 aa  437  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  45.79 
 
 		 509 aa  436  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  45.98 
 
 		 510 aa  435  1e-120  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  43.53 
 
 		 565 aa  433  1e-120  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  40.64 
 
 		 532 aa  422  1e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  38.9 
 
 		 535 aa  392  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  40.65 
 
 		 556 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  41.95 
 
 		 567 aa  376  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 		 515 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 398 aa  57  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  23.23 
 
 		 393 aa  57  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 412 aa  53.9  0.000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  21.77 
 
 		 393 aa  51.6  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  20.62 
 
 		 398 aa  50.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0942  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.12 
 
 		 453 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000162674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1499  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  34.55 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.549888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  29.9 
 
 		 462 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 410 aa  44.3  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2047  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.1 
 
 		 497 aa  43.9  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731125 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0185  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.88 
 
 		 440 aa  43.9  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0421  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.05 
 
 		 439 aa  43.5  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>