37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0399 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  60.04 
 
 		 557 aa  645    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  68.69 
 
 		 553 aa  776    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  61.06 
 
 		 547 aa  657    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 550 aa  1104    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  61.54 
 
 		 551 aa  687    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  45.64 
 
 		 566 aa  462  1e-129  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  45.45 
 
 		 575 aa  455  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  44.81 
 
 		 551 aa  444  1e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  44.63 
 
 		 551 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  41.71 
 
 		 625 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  43.94 
 
 		 565 aa  412  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  40.79 
 
 		 556 aa  413  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  40.49 
 
 		 542 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  41.46 
 
 		 575 aa  405  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  42.48 
 
 		 572 aa  404  1e-111  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  44.32 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  43.32 
 
 		 565 aa  399  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  41.18 
 
 		 595 aa  395  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  43.22 
 
 		 565 aa  390  1e-107  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  40.31 
 
 		 590 aa  388  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  42.06 
 
 		 565 aa  379  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  43.15 
 
 		 567 aa  375  1e-102  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  38.49 
 
 		 532 aa  363  5.0000000000000005e-99  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  40.04 
 
 		 535 aa  362  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 		 517 aa  354  2e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 510 aa  352  1e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  40.51 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  41.39 
 
 		 509 aa  349  7e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  41.3 
 
 		 510 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  36.85 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.21 
 
 		 510 aa  50.8  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 393 aa  45.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 435 aa  45.1  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 502 aa  43.5  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>