129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2769 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  73.98 
 
 		 625 aa  881    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  73.28 
 
 		 590 aa  879    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  78.28 
 
 		 572 aa  920    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  89.88 
 
 		 575 aa  1052    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 595 aa  1215    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  45.49 
 
 		 575 aa  491  1e-137  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  43.21 
 
 		 566 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  44.14 
 
 		 551 aa  431  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  43.49 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  43.78 
 
 		 551 aa  427  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  42.06 
 
 		 542 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  39.62 
 
 		 556 aa  420  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  43.99 
 
 		 547 aa  409  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  40.97 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  41.64 
 
 		 557 aa  402  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  42.12 
 
 		 565 aa  404  1e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  38.94 
 
 		 565 aa  395  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  38 
 
 		 532 aa  395  1e-108  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  41.41 
 
 		 556 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  40.52 
 
 		 565 aa  392  1e-107  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 		 565 aa  385  1e-105  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  40.64 
 
 		 509 aa  373  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  39.66 
 
 		 510 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  40.15 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  39.25 
 
 		 517 aa  371  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  40.15 
 
 		 510 aa  371  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  40.07 
 
 		 535 aa  363  6e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  38.42 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  39.56 
 
 		 567 aa  355  2e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  40.26 
 
 		 398 aa  57  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 393 aa  56.2  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  33.64 
 
 		 420 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2337  hypothetical protein  23.84 
 
 		 458 aa  52.4  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.587976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.6 
 
 		 420 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 		 410 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.22 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125377  hitchhiker  0.0000111604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3120  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  44.29 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  31 
 
 		 441 aa  48.9  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1314  hypothetical protein  24.58 
 
 		 453 aa  47.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000395672  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  30.93 
 
 		 427 aa  48.1  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1803  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.89 
 
 		 524 aa  47.8  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.6995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 489 aa  47.8  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  23.38 
 
 		 368 aa  47  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1787  putative tRNA modifying protein  40.54 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.738768  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0353  hypothetical protein  33.75 
 
 		 466 aa  47  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2197  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  37.84 
 
 		 470 aa  46.6  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  24.73 
 
 		 528 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  21.34 
 
 		 398 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1639  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.54 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.981602 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 542 aa  47  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1536  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.54 
 
 		 525 aa  46.2  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0262193 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1074  hypothetical protein  26.42 
 
 		 432 aa  46.2  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4336  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.96 
 
 		 449 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.412924 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1715  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.54 
 
 		 531 aa  46.2  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26780  predicted protein  44.23 
 
 		 516 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  45.45 
 
 		 523 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1444  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.55 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4276  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  38.96 
 
 		 449 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1614  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.26 
 
 		 471 aa  46.2  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0719193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0531  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  34.55 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3627  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  40.54 
 
 		 437 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.109581  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1354  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.14 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01161  Fe-S oxidoreductase  31.53 
 
 		 462 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.924562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  38 
 
 		 527 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1913  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  31.41 
 
 		 454 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.823404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2751  hypothetical protein  23.84 
 
 		 440 aa  45.4  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.639812 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1673  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  26.23 
 
 		 554 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  38 
 
 		 527 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 515 aa  45.1  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02161  Fe-S oxidoreductase  38.6 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0926  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.58 
 
 		 452 aa  45.4  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 467 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  32.35 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 543 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1944  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0618  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.85 
 
 		 448 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000754849  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2590  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  41.43 
 
 		 468 aa  45.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.58458  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1636  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  22.84 
 
 		 453 aa  44.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.413832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  36 
 
 		 527 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3094  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  43.55 
 
 		 450 aa  45.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000316014  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 547 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0973  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  28.04 
 
 		 463 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.614031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  27.59 
 
 		 547 aa  45.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00802  predicted SAM-dependent methyltransferase  39.19 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  39.19 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0082  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40.54 
 
 		 437 aa  44.7  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0566  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  35.45 
 
 		 437 aa  44.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 497 aa  44.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  47.73 
 
 		 547 aa  44.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00819  hypothetical protein  39.19 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0895  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.465773  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0906  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  47.73 
 
 		 547 aa  44.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0862  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.746353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2510  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  39.19 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105116  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3089  hypothetical protein  58.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000479823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>