More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1264 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1191  radical SAM domain-containing protein  98.19 
 
 		 551 aa  1100    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000804505  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1264  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 551 aa  1115    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0716  radical SAM domain-containing protein  48.55 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0774  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 		 515 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2273  radical SAM domain-containing protein  43.7 
 
 		 553 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.598477  normal  0.253528 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2101  hypothetical protein  42.61 
 
 		 575 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.833726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0756  hypothetical protein  44.18 
 
 		 551 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.196935  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2247  radical SAM family Fe-S protein  41.84 
 
 		 566 aa  437  1e-121  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.747344  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  44.6 
 
 		 575 aa  434  1e-120  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0927  Radical SAM domain protein  43.7 
 
 		 556 aa  432  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.522384  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0399  radical SAM domain-containing protein  44.63 
 
 		 550 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.34562  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1190  Radical SAM domain protein  42.39 
 
 		 590 aa  426  1e-118  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2769  Radical SAM domain protein  43.78 
 
 		 595 aa  427  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.847713  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  42.66 
 
 		 572 aa  424  1e-117  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  42.83 
 
 		 556 aa  424  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17240  Radical SAM domain protein  42 
 
 		 542 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0640  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 		 625 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.47984  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0148  Radical SAM domain protein  41.93 
 
 		 547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0117639 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0614  radical SAM family protein  41.5 
 
 		 557 aa  404  1e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0664255 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2352  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 		 565 aa  384  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.530094 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0677  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 		 565 aa  373  1e-102  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.866452  normal  0.655818 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2121  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 		 565 aa  373  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1460  radical SAM domain-containing protein  43.42 
 
 		 509 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1286  Radical SAM domain protein  40.25 
 
 		 532 aa  367  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.718238  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1989  radical SAM domain-containing protein  39.61 
 
 		 565 aa  365  1e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0303  radical SAM domain-containing protein  41.49 
 
 		 510 aa  355  1e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  41.99 
 
 		 510 aa  352  7e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1438  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 		 517 aa  350  6e-95  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.328517  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1611  radical SAM domain-containing protein  40.59 
 
 		 510 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.204247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0475  radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 		 567 aa  335  1e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 		 412 aa  76.3  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  25.28 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.09 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.4 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 398 aa  67  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0454  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.77 
 
 		 430 aa  66.6  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000369122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.36 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.36 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0774  RNA modification enzyme, MiaB family  25.97 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0255462  normal  0.23064 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  25.26 
 
 		 372 aa  65.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  24.12 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.81 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  22.99 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  28.33 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  23.66 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25170  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG, TIGR01125  29.22 
 
 		 480 aa  63.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.5 
 
 		 447 aa  63.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  27.22 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  26.11 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 410 aa  62  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0963  RNA modification enzyme, MiaB family  22.3 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2374  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.13 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.997714 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  24.73 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2424  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.34 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0034  2-methylthioadenine synthetase  24.81 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2979  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.13 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0122351  hitchhiker  0.00203806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  24.01 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  21.93 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1467  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.56 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.369998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.66 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1699  RNA modification enzyme, MiaB family  25.93 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000319842  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1354  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  29.19 
 
 		 507 aa  58.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027921 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1369  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.95 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.121645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  22.12 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.86 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1396  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.23 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.718016 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1273  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.229003  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1621  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  21.77 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0278587  hitchhiker  0.00000000647105 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1464  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  22.71 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.53 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.55 
 
 		 510 aa  57  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0252  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.92 
 
 		 441 aa  57  0.0000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.79 
 
 		 485 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000125377  hitchhiker  0.0000111604 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.35 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 369 aa  56.6  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5800  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.23 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.740165  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0837  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.1 
 
 		 442 aa  55.8  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.994025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3120  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.64 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1195  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.11 
 
 		 418 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00789069  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1591  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.22 
 
 		 445 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.712664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.35 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  23.59 
 
 		 369 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3124  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.24 
 
 		 442 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000009336  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  25.21 
 
 		 437 aa  55.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0582  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.84 
 
 		 444 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362329  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 369 aa  55.5  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1385  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.45 
 
 		 418 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000358756  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  24.43 
 
 		 449 aa  54.7  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3288  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.1 
 
 		 451 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2319  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.64 
 
 		 480 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200937  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1501  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.14 
 
 		 471 aa  54.3  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.49 
 
 		 462 aa  54.3  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  21.15 
 
 		 417 aa  54.3  0.000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2283  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  21.25 
 
 		 442 aa  54.3  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.135903  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4999  MiaB family RNA modification protein  25.47 
 
 		 453 aa  54.3  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>