More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1044 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  94.85 
 
 
369 aa  719    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
369 aa  753    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  95.39 
 
 
369 aa  722    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  77.84 
 
 
372 aa  600  1e-170  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  60.92 
 
 
378 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  44.33 
 
 
377 aa  317  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  46.03 
 
 
368 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 
371 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  39.36 
 
 
366 aa  281  2e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  42.3 
 
 
369 aa  279  7e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  41.39 
 
 
405 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  42.01 
 
 
393 aa  261  1e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  40.3 
 
 
372 aa  259  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  38.08 
 
 
369 aa  259  7e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 
360 aa  256  6e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  39.36 
 
 
398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 
495 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  41.05 
 
 
397 aa  242  7.999999999999999e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  40.94 
 
 
397 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  34.28 
 
 
451 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  31.44 
 
 
393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  31.44 
 
 
410 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 
398 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  30.5 
 
 
412 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  30.12 
 
 
455 aa  103  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 
438 aa  94.7  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  31.01 
 
 
430 aa  95.1  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 
435 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 
1250 aa  94.4  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 
533 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  22.98 
 
 
529 aa  92  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  24.91 
 
 
529 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  24.26 
 
 
527 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 
434 aa  87.4  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 
470 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 
497 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  28.88 
 
 
441 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  27.17 
 
 
437 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 
441 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  24.2 
 
 
482 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.12 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.35 
 
 
439 aa  82.8  0.000000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 
533 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 
459 aa  82  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  28.57 
 
 
533 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  25.27 
 
 
444 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2334  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  24.22 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1155  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.08 
 
 
474 aa  81.6  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  25.99 
 
 
461 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 
529 aa  80.9  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25.47 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.55 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  27.87 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  28.38 
 
 
529 aa  80.5  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  25.17 
 
 
488 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.24 
 
 
437 aa  79.7  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2296  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.35 
 
 
441 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00249706  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0893  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  23.94 
 
 
474 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  20.37 
 
 
501 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  24.01 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.81 
 
 
522 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  23.62 
 
 
564 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0065  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.93 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1197  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.16 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0761  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.9 
 
 
441 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.206717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3134  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.31 
 
 
474 aa  77.4  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  24.24 
 
 
437 aa  77.8  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 
461 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2198  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.43 
 
 
446 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.972973  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1323  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.53 
 
 
482 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0560356  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.3 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  22.85 
 
 
473 aa  77  0.0000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 
528 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.77 
 
 
448 aa  77  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12350  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.07 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  25 
 
 
441 aa  76.6  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 
529 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0697  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.43 
 
 
462 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.224906 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.23 
 
 
434 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 
450 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2575  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.77 
 
 
483 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.687203  normal  0.0756163 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1128  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.77 
 
 
446 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1008  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.53 
 
 
474 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal  0.0977371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 
518 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3779  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.12 
 
 
459 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.73 
 
 
451 aa  76.3  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00629  isopentenyl-adenosine A37 tRNA methylthiolase  25.31 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.194806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2965  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.31 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00048321  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.54 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  26.1 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0715  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.31 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0188507  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0776  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.31 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.410569  normal  0.687788 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0684  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.31 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00591488  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0755  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.31 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00437825  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0708  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.31 
 
 
474 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000784837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 
524 aa  75.9  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 
476 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0788  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.31 
 
 
474 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>