More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1724 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  72.37 
 
 		 529 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  70.73 
 
 		 529 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  71.98 
 
 		 527 aa  794    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  63.12 
 
 		 524 aa  678    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  69.01 
 
 		 522 aa  766    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  68.35 
 
 		 522 aa  743    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  100 
 
 		 533 aa  1105    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  70.21 
 
 		 529 aa  780    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  63.91 
 
 		 524 aa  691    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  56.64 
 
 		 529 aa  608  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  54.83 
 
 		 523 aa  575  1.0000000000000001e-163  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  53.31 
 
 		 525 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  54.47 
 
 		 533 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  39.92 
 
 		 504 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  47.8 
 
 		 600 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  41.62 
 
 		 561 aa  385  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 		 509 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  40.12 
 
 		 504 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  39.1 
 
 		 504 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  40 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  39.39 
 
 		 503 aa  364  2e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  39.84 
 
 		 498 aa  364  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  45.69 
 
 		 512 aa  364  2e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  40.16 
 
 		 502 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  38.9 
 
 		 501 aa  360  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 		 498 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  39.96 
 
 		 493 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  38.77 
 
 		 546 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  38.01 
 
 		 520 aa  349  7e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  38.83 
 
 		 490 aa  343  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  38.91 
 
 		 521 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  39.31 
 
 		 534 aa  323  4e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  37.16 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  33.73 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  35.32 
 
 		 527 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  34.81 
 
 		 527 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  35.21 
 
 		 528 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  34.82 
 
 		 539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  33.47 
 
 		 553 aa  287  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  33.19 
 
 		 546 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  34.18 
 
 		 527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  33.62 
 
 		 523 aa  284  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  34.24 
 
 		 527 aa  283  8.000000000000001e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  32.85 
 
 		 547 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  33.12 
 
 		 547 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  33.12 
 
 		 547 aa  277  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 		 547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  34.91 
 
 		 542 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 		 543 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 531 aa  272  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  34.97 
 
 		 532 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 		 527 aa  220  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  28.6 
 
 		 430 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  30.13 
 
 		 428 aa  180  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  29.02 
 
 		 444 aa  168  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  30.24 
 
 		 434 aa  163  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 433 aa  163  9e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  27.77 
 
 		 428 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 446 aa  157  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  28.95 
 
 		 428 aa  156  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 439 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 471 aa  151  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 		 459 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 444 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  28.89 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 448 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 471 aa  136  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  25.7 
 
 		 441 aa  134  5e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  26.65 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 474 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  24.77 
 
 		 490 aa  127  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 470 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.61 
 
 		 479 aa  123  8e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  26.44 
 
 		 473 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.39 
 
 		 441 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 441 aa  118  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  24.8 
 
 		 495 aa  118  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.09 
 
 		 471 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 483 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.56 
 
 		 478 aa  117  5e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.73 
 
 		 472 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  25.66 
 
 		 433 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 459 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>