More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1323 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  72.6 
 
 
438 aa  681    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  91.76 
 
 
437 aa  830    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  93.2 
 
 
441 aa  847    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
441 aa  900    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  62.9 
 
 
455 aa  555  1e-157  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  49.66 
 
 
430 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  45.54 
 
 
435 aa  420  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  43.05 
 
 
444 aa  382  1e-105  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 
450 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 
564 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
1250 aa  97.4  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  29.79 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 
393 aa  94  5e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.08 
 
 
473 aa  93.6  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.95 
 
 
473 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 
473 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 
476 aa  90.9  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 
369 aa  90.5  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  24.51 
 
 
444 aa  90.1  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  24.38 
 
 
564 aa  89.7  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 
471 aa  89.7  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 
458 aa  89.7  9e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 
490 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 
473 aa  89  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 
405 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  28.33 
 
 
459 aa  88.2  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 
528 aa  88.2  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 
461 aa  87.4  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 
369 aa  87.8  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2153  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.26 
 
 
467 aa  86.7  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2066  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.26 
 
 
467 aa  86.7  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0928241  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  27.08 
 
 
497 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 
503 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 
518 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3300  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.61 
 
 
454 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3625  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.22 
 
 
448 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0208192  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02230  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.07 
 
 
477 aa  84.7  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.08 
 
 
472 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  27.85 
 
 
476 aa  84.3  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.61 
 
 
437 aa  84.3  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  28.67 
 
 
488 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.16 
 
 
462 aa  83.6  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0675  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.05 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00122823  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.88 
 
 
456 aa  83.2  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  23.51 
 
 
501 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.75 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 
489 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 
533 aa  83.2  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.53 
 
 
554 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2935  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.7 
 
 
448 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.448542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 
556 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0242  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.3 
 
 
473 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0875  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.01 
 
 
449 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 
451 aa  82  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0468  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.54 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 
495 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3617  RNA modification protein  24.69 
 
 
467 aa  81.3  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1184  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.1 
 
 
482 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  24.2 
 
 
501 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  26.33 
 
 
563 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.49 
 
 
476 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1074  hypothetical protein  24.09 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.1 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 
441 aa  81.6  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  24.54 
 
 
470 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  29.95 
 
 
647 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0452  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.32 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.77 
 
 
451 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3127  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 
475 aa  80.9  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543412  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0683  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.66 
 
 
439 aa  80.5  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 
433 aa  80.1  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  26.91 
 
 
475 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2206  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.17 
 
 
477 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163044  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0748  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.12 
 
 
451 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000201593 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1115  RNA modification protein  29.89 
 
 
410 aa  79.7  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4804  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  27.56 
 
 
442 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3527  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.39 
 
 
445 aa  79.7  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.70127  normal  0.0537837 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  24.75 
 
 
377 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 
424 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  29.17 
 
 
444 aa  79  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0815  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.13 
 
 
474 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.518206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  22.3 
 
 
506 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0596  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.12 
 
 
451 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  22.31 
 
 
476 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4345  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.83 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.8 
 
 
478 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 
487 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  26.58 
 
 
475 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1243  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 
458 aa  79  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1120  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.76 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 
576 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2334  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  29.41 
 
 
459 aa  78.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 
428 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0031  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 
473 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191379 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0713  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.15 
 
 
474 aa  79  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1515  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.5 
 
 
442 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.561512  normal  0.183018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>