More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2205 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  74.7 
 
 
430 aa  666    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  74.76 
 
 
428 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  100 
 
 
428 aa  889    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  71.39 
 
 
429 aa  632  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  43.87 
 
 
444 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  42.12 
 
 
433 aa  364  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  40.8 
 
 
439 aa  340  4e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  43.3 
 
 
428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  42.67 
 
 
426 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  42.3 
 
 
434 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  40.48 
 
 
446 aa  313  5.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  39.42 
 
 
471 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  37.97 
 
 
471 aa  302  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 
477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  37.53 
 
 
444 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  35.07 
 
 
448 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  38.56 
 
 
490 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  37.04 
 
 
486 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 
477 aa  268  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  33.25 
 
 
441 aa  265  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  35.02 
 
 
471 aa  264  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  37.23 
 
 
434 aa  262  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  32.18 
 
 
449 aa  247  4e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  38.46 
 
 
433 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 
445 aa  244  3e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 
462 aa  242  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 
459 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.99 
 
 
461 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 
467 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.69 
 
 
471 aa  223  6e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 
469 aa  222  8e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.12 
 
 
465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0919  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 
422 aa  219  7e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  34.05 
 
 
504 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 
475 aa  216  5e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 
468 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  31.95 
 
 
469 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.69 
 
 
471 aa  212  7.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
501 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.65 
 
 
462 aa  209  8e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
480 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.63 
 
 
479 aa  207  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  31.41 
 
 
483 aa  206  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2731  Radical SAM domain protein  29.22 
 
 
465 aa  206  6e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  33.41 
 
 
504 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.6 
 
 
466 aa  202  6e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  30.31 
 
 
468 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.53 
 
 
478 aa  201  3e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  32.3 
 
 
504 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 
476 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0200  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 
468 aa  199  7e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0997671  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 
471 aa  199  9e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 
527 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 
472 aa  197  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 
502 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  31.89 
 
 
498 aa  195  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  29.87 
 
 
470 aa  194  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 
502 aa  193  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.88 
 
 
472 aa  193  5e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1806  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 
468 aa  193  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 
509 aa  192  8e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 
468 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  33 
 
 
512 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 
520 aa  189  5.999999999999999e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 
473 aa  189  1e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 
474 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  28.76 
 
 
477 aa  186  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.83 
 
 
461 aa  186  9e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 
533 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 
469 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  30.64 
 
 
444 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  28.6 
 
 
498 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  26.65 
 
 
462 aa  182  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  29.82 
 
 
529 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  30.13 
 
 
533 aa  180  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  28.03 
 
 
522 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  28.86 
 
 
490 aa  178  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  30.24 
 
 
503 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3535  Radical SAM domain protein  31.2 
 
 
444 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 
500 aa  177  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  30 
 
 
503 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  28.84 
 
 
523 aa  176  5e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  30.79 
 
 
445 aa  176  6e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  26.8 
 
 
529 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 
448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.7 
 
 
522 aa  174  2.9999999999999996e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
503 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  27.54 
 
 
493 aa  170  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  31.39 
 
 
532 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 
451 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  28.38 
 
 
527 aa  167  4e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 
529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  27.51 
 
 
524 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 
600 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  29.16 
 
 
450 aa  163  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.32 
 
 
524 aa  162  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  29.07 
 
 
441 aa  159  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  28.84 
 
 
441 aa  158  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  30.61 
 
 
546 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>