More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2409 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 495 aa  945    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  47.55 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  40.15 
 
 		 405 aa  315  9.999999999999999e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  39.27 
 
 		 377 aa  256  7e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  38.79 
 
 		 368 aa  251  1e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 369 aa  250  5e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  37.61 
 
 		 369 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 398 aa  249  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  36.72 
 
 		 369 aa  246  6.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  41.33 
 
 		 371 aa  242  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  36.29 
 
 		 372 aa  238  1e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 		 393 aa  238  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 		 397 aa  233  9e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  37.96 
 
 		 397 aa  228  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  34.24 
 
 		 378 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  42.37 
 
 		 369 aa  212  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  42.5 
 
 		 360 aa  204  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  38.58 
 
 		 393 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  39.51 
 
 		 372 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  36.06 
 
 		 366 aa  194  4e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  38.37 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  37.76 
 
 		 412 aa  187  5e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  37.13 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 435 aa  97.4  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  29.25 
 
 		 444 aa  95.5  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  32.02 
 
 		 518 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 529 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 460 aa  90.1  9e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  32.65 
 
 		 430 aa  88.2  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 		 488 aa  87.8  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  29.82 
 
 		 624 aa  86.7  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 441 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2334  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  31.37 
 
 		 459 aa  80.5  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 489 aa  79.7  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 437 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  30.92 
 
 		 681 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  25.54 
 
 		 562 aa  78.6  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2361  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  33.17 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.166374  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3300  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.43 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  25.07 
 
 		 597 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27.25 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0584  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.89 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1999  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.09 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  27.51 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 		 507 aa  74.3  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  26.36 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2139  RNA modification enzyme, MiaB family  28.03 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3373  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.65 
 
 		 447 aa  73.9  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 494 aa  73.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3617  RNA modification protein  32.02 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2355  RNA modification protein  33.71 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1357  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.31 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0245853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  27.97 
 
 		 494 aa  73.2  0.000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 501 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1120  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.24 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2909  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.4 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  27.97 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 622 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2855  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.03 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.82 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1243  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.67 
 
 		 458 aa  72.4  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2206  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.55 
 
 		 477 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1459  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  31.5 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.178444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.02 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0597  radical SAM family protein  27.15 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.678652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0832  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  24.29 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2173  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  32.2 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  29.97 
 
 		 554 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 		 557 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.71 
 
 		 437 aa  70.1  0.00000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 503 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 506 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0713  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  30.74 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  35.98 
 
 		 506 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  32.5 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3303  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.6 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668925  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3439  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.6 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0893  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  29.4 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188426  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0865  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.33 
 
 		 454 aa  68.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278844  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0235  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.85 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0651  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.46 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  27.11 
 
 		 849 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 559 aa  68.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 617 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  26.57 
 
 		 842 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  26.18 
 
 		 486 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3365  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.04 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  25.59 
 
 		 520 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1106  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  31.6 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000160035 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1721  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.23 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.081167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2292  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.65 
 
 		 453 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>