More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0686 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 378 aa  768    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  61.17 
 
 		 372 aa  495  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  61.46 
 
 		 369 aa  473  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  60.92 
 
 		 369 aa  472  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  60.65 
 
 		 369 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  41.04 
 
 		 377 aa  298  1e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  41.41 
 
 		 368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  38.26 
 
 		 371 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  42.51 
 
 		 369 aa  273  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  40.53 
 
 		 360 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  39.26 
 
 		 366 aa  265  8e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  41.27 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  38.32 
 
 		 369 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  38.52 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  37.5 
 
 		 398 aa  248  9e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  35.93 
 
 		 495 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  33.42 
 
 		 372 aa  230  4e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 		 397 aa  228  1e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  34.25 
 
 		 451 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  31.71 
 
 		 393 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  32.62 
 
 		 398 aa  187  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  32.54 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  32.62 
 
 		 412 aa  176  4e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 435 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  25.61 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 529 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  27.52 
 
 		 455 aa  83.6  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 528 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  24.73 
 
 		 529 aa  82  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 522 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 527 aa  79.3  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.61 
 
 		 522 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  25.49 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  24.41 
 
 		 467 aa  77  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.09 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0237  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.07 
 
 		 447 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 		 502 aa  75.5  0.000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 524 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  29.75 
 
 		 437 aa  75.5  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.04 
 
 		 1250 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 459 aa  74.3  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  24.75 
 
 		 482 aa  74.3  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  27.05 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 533 aa  74.3  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1724  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.96 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  27.02 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2352  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.96 
 
 		 443 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  25.72 
 
 		 444 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0065  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.92 
 
 		 451 aa  72.4  0.00000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  26.18 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 520 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 459 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  27.39 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 533 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3134  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.77 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  20.49 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1323  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.64 
 
 		 482 aa  70.1  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0560356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1197  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.77 
 
 		 474 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 490 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1155  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.76 
 
 		 474 aa  68.9  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 616 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  23.28 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  29.31 
 
 		 529 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.18 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2334  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  23.41 
 
 		 459 aa  68.6  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0818  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.62 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.069148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  25.08 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 451 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1719  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.219309  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  28.32 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.45 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02230  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.5 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  21.33 
 
 		 441 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3005  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.77 
 
 		 509 aa  66.6  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.187543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  22.61 
 
 		 554 aa  66.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0616  RNA modification protein  23.98 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.776827  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 460 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.42 
 
 		 441 aa  66.2  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0893  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.4 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>