More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1283 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 451 aa  912    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  47.67 
 
 		 495 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  41.03 
 
 		 405 aa  309  6.999999999999999e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  35.85 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  37.57 
 
 		 377 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  37.41 
 
 		 397 aa  238  1e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  37.17 
 
 		 397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  34.46 
 
 		 372 aa  219  6e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  34.84 
 
 		 369 aa  217  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  34.28 
 
 		 369 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  35.21 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  38.44 
 
 		 371 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  33.98 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  33.52 
 
 		 378 aa  204  3e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  37.63 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  40.18 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  40.66 
 
 		 360 aa  200  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  38.41 
 
 		 366 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  37.76 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  34.07 
 
 		 410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  35.47 
 
 		 372 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  34.29 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  28.09 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 533 aa  90.5  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  30.23 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 529 aa  87  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 459 aa  87  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 461 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0516  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  26.47 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  26.47 
 
 		 494 aa  84  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  28.42 
 
 		 624 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.64 
 
 		 512 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 468 aa  81.3  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  24.56 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  26.41 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  26.27 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 489 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1165  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 506 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.48 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3467  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 		 488 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 507 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.53 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  26.79 
 
 		 548 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 484 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  26.49 
 
 		 503 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  29.45 
 
 		 554 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3533  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3300  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.82 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.170936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  31.32 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 552 aa  73.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  30.84 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 520 aa  73.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  23.61 
 
 		 425 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 490 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.67 
 
 		 429 aa  72.4  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 528 aa  72.4  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2855  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.73 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  25 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.91 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 494 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 461 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0820  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.48 
 
 		 437 aa  71.6  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.696196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 502 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.83 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  27.24 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.39 
 
 		 456 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2129  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.79 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0560251  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 494 aa  70.5  0.00000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  26.53 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3303  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.18 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668925  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  23.84 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1106  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.18 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000160035 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3439  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.18 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000703202 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 530 aa  70.5  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.86 
 
 		 609 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1112  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  28.97 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000242644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3261  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  28.18 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.803494  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 597 aa  70.1  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1435  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 631 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0826343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  25.94 
 
 		 864 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  25.8 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  25.23 
 
 		 521 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  27.39 
 
 		 456 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0815  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.97 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.518206  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0138  Radical SAM domain protein  28.62 
 
 		 608 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000809293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>