More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0101 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  65.98 
 
 		 589 aa  739    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  59.68 
 
 		 625 aa  728    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  100 
 
 		 624 aa  1252    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0741  radical SAM domain-containing protein  58.71 
 
 		 623 aa  646    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  50.48 
 
 		 622 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  52.5 
 
 		 616 aa  592  1e-168  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  57.34 
 
 		 490 aa  488  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  48.42 
 
 		 609 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 557 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 557 aa  211  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  29.35 
 
 		 569 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  30.27 
 
 		 562 aa  196  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  29.16 
 
 		 600 aa  191  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0197  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 656 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  28.38 
 
 		 583 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  28.76 
 
 		 584 aa  176  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 		 570 aa  174  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  25.5 
 
 		 590 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  26.39 
 
 		 559 aa  170  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  26.2 
 
 		 590 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  26.68 
 
 		 535 aa  167  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1616  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 559 aa  164  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.710753  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3713  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 669 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  28.75 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.77 
 
 		 583 aa  150  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4724  Radical SAM domain protein  28.37 
 
 		 581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 		 504 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  29.33 
 
 		 472 aa  144  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  25.05 
 
 		 502 aa  136  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0866  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase family protein, putative  28.64 
 
 		 504 aa  135  3e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1571  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 505 aa  134  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.805269  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3180  radical SAM domain-containing protein  28.43 
 
 		 646 aa  131  5.0000000000000004e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4256  radical SAM family protein  27.09 
 
 		 536 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4163  radical SAM family protein  28.03 
 
 		 524 aa  128  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0387  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 552 aa  128  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  0.247194 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  28.42 
 
 		 472 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2424  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.4 
 
 		 551 aa  124  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  28.49 
 
 		 473 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3079  radical SAM family protein  26.75 
 
 		 530 aa  120  7.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.265778  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2413  radical SAM domain-containing protein  29.48 
 
 		 437 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0959  radical SAM family protein  26.5 
 
 		 530 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  28.14 
 
 		 472 aa  118  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  26.99 
 
 		 625 aa  117  6e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 518 aa  115  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  31.48 
 
 		 564 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  28.01 
 
 		 864 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2412  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 		 459 aa  103  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  24.44 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  24.44 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 494 aa  101  4e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1134  putative Fe-S oxidoreductase  22.62 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 		 564 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  23.33 
 
 		 494 aa  99  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 502 aa  98.2  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  29.45 
 
 		 563 aa  97.1  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  28.79 
 
 		 512 aa  96.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 556 aa  95.5  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  27.73 
 
 		 554 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 529 aa  94.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  27.35 
 
 		 501 aa  94.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  27.79 
 
 		 618 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 		 424 aa  91.3  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  26.63 
 
 		 377 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  28.45 
 
 		 424 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  24.85 
 
 		 548 aa  89.7  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 441 aa  88.6  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  30.18 
 
 		 495 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  23.61 
 
 		 484 aa  88.2  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 524 aa  88.2  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  25.9 
 
 		 444 aa  87.8  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  26.57 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  27.03 
 
 		 461 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 		 468 aa  85.5  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.73 
 
 		 674 aa  84.7  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 533 aa  82.4  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 521 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  26.34 
 
 		 488 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  22.83 
 
 		 723 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  26.08 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  25.51 
 
 		 501 aa  80.5  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27.33 
 
 		 677 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1863  radical SAM family protein  23.19 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300057  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.56 
 
 		 484 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  26.21 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  25.68 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  23.18 
 
 		 566 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 525 aa  79.3  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 461 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 459 aa  77.8  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.71 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  27.93 
 
 		 451 aa  77.4  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2472  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 507 aa  77  0.0000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4370  radical SAM domain-containing protein  27.3 
 
 		 501 aa  76.6  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2407  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>