178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1284 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  63.5 
 
 		 528 aa  734    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 530 aa  1080    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  56.54 
 
 		 502 aa  599  1e-170  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 		 497 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 526 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  32.12 
 
 		 531 aa  228  3e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 515 aa  224  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 530 aa  216  9.999999999999999e-55  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 532 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 531 aa  211  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 546 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 		 524 aa  194  3e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 		 503 aa  191  4e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 548 aa  188  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  31 
 
 		 503 aa  186  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  27.26 
 
 		 574 aa  176  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0896  hypothetical protein  29.22 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 369 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  27.27 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  28.1 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 398 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1283  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.340157  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  27.36 
 
 		 369 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  23.78 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 369 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  24.41 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  33.11 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  25.69 
 
 		 372 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  22.76 
 
 		 360 aa  61.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  25.58 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3801  RNA modification enzyme, MiaB family  23.02 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.920944  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  24.74 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  32.8 
 
 		 459 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 451 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  30.97 
 
 		 498 aa  58.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.51 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.280918  normal  0.0609145 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  26.01 
 
 		 509 aa  57.8  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.15 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.15 
 
 		 443 aa  55.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  23.83 
 
 		 446 aa  55.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0796  RNA modification protein  24.19 
 
 		 468 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  21.43 
 
 		 368 aa  54.7  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 371 aa  54.7  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  30.08 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  24.77 
 
 		 435 aa  54.7  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  20.79 
 
 		 441 aa  54.7  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 410 aa  54.3  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  22.68 
 
 		 378 aa  53.5  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1513  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  34.33 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.627818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 502 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  20.53 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 502 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.81 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2167  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 499 aa  52.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.298857  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 498 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 490 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 		 433 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  26.61 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3627  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  29.87 
 
 		 437 aa  51.6  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.109581  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  22.95 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3535  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0408  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.42 
 
 		 456 aa  50.4  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0921493 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0713  hypothetical protein  34.33 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.66 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2865  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  25.81 
 
 		 453 aa  49.7  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  24.84 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  34.55 
 
 		 533 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  21.02 
 
 		 366 aa  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 397 aa  50.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  29.13 
 
 		 502 aa  49.3  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 448 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 523 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  22.12 
 
 		 398 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  25.75 
 
 		 545 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.83 
 
 		 466 aa  48.5  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  30.28 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  29.77 
 
 		 444 aa  48.5  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0959  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 530 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3079  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 530 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.265778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  28.46 
 
 		 449 aa  48.5  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0423  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.42 
 
 		 456 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.502734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2166  radical SAM family Fe-S protein  19.92 
 
 		 495 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 501 aa  48.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  24.24 
 
 		 529 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  19.95 
 
 		 471 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 468 aa  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  31.21 
 
 		 428 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1662  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.66 
 
 		 427 aa  47.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00220183  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3986  RNA modification enzyme, MiaB family  23.38 
 
 		 508 aa  47.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219223  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.82 
 
 		 522 aa  47.4  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0713  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.86 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0124358  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>