More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3555 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 448 aa  924    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  42.26 
 
 		 450 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  40.71 
 
 		 444 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  39.51 
 
 		 445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3535  Radical SAM domain protein  39.86 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  36.36 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  33.25 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 		 446 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  32.94 
 
 		 477 aa  190  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  33.25 
 
 		 429 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  31.9 
 
 		 449 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  34.3 
 
 		 444 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  31.41 
 
 		 441 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  34.83 
 
 		 426 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  31.3 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 		 428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  33.33 
 
 		 430 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  33.63 
 
 		 480 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 444 aa  172  9e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.82 
 
 		 479 aa  171  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  34.84 
 
 		 434 aa  169  9e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  35.4 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  34.31 
 
 		 471 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  33.72 
 
 		 483 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  33.81 
 
 		 486 aa  159  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  30.53 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 		 459 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  32.37 
 
 		 470 aa  153  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  30.02 
 
 		 434 aa  153  7e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  32.57 
 
 		 477 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.17 
 
 		 471 aa  149  7e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  31.01 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 441 aa  147  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  30.2 
 
 		 441 aa  146  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  34.47 
 
 		 472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 469 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.73 
 
 		 465 aa  143  5e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.09 
 
 		 466 aa  143  6e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.85 
 
 		 461 aa  143  6e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1806  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  29.63 
 
 		 468 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.11 
 
 		 462 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 		 433 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 		 474 aa  139  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.49 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0200  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0997671  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2731  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  28.71 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 		 467 aa  136  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  27.7 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 		 477 aa  135  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 		 471 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 476 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 469 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 		 473 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.29 
 
 		 471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 462 aa  130  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 468 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  29.71 
 
 		 490 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  30.56 
 
 		 591 aa  124  4e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.54 
 
 		 461 aa  122  9e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  26.56 
 
 		 467 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 520 aa  109  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  26.81 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  31.04 
 
 		 532 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  29.69 
 
 		 527 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  25.78 
 
 		 509 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 489 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 512 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 502 aa  103  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 600 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0919  radical SAM domain-containing protein  28.06 
 
 		 422 aa  99.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  28.12 
 
 		 504 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 501 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 		 504 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 498 aa  97.1  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 493 aa  96.7  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  28.79 
 
 		 490 aa  95.9  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  26.25 
 
 		 500 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2772  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 598 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2490  radical SAM family protein  27.46 
 
 		 605 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.497518  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3468  radical SAM family protein  25 
 
 		 592 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.453671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 		 502 aa  91.3  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0906  cobalamin B12-binding domain protein  27.59 
 
 		 456 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1164  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 481 aa  90.1  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0204  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 452 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0138  Radical SAM domain protein  28.19 
 
 		 608 aa  90.1  8e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000809293  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  27.41 
 
 		 485 aa  90.1  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2416  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 469 aa  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1899  radical SAM family protein  26.35 
 
 		 591 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4810  radical SAM family protein  26.86 
 
 		 607 aa  88.2  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 503 aa  87.8  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 470 aa  87.4  5e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 459 aa  87  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1507  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 591 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>