46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0336 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 526 aa  1097    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  35.1 
 
 		 524 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 		 530 aa  246  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 528 aa  240  5.999999999999999e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 		 574 aa  232  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  30.71 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 515 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 		 497 aa  208  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 532 aa  204  2e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 		 503 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 531 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 530 aa  199  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  30.44 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 502 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 546 aa  192  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 548 aa  187  5e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.93 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  24.21 
 
 		 398 aa  53.5  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.85 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 484 aa  51.2  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 435 aa  50.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 393 aa  50.4  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.07 
 
 		 425 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.21 
 
 		 425 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  21.54 
 
 		 410 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.48 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22 
 
 		 472 aa  47  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 473 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 533 aa  46.2  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3572  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  20.22 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2206  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.06 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0163044  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 681 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0896  hypothetical protein  33.04 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1315  RNA modification protein  24.88 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.107305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  21.78 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.26 
 
 		 422 aa  44.3  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 475 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.87 
 
 		 472 aa  43.5  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07660  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.47 
 
 		 409 aa  43.5  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.738464 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1287  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.05 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1288  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.05 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  21.22 
 
 		 472 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>