137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1133 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 531 aa  1085    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  54.16 
 
 		 503 aa  534  1e-150  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  52.24 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  51.42 
 
 		 515 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  51.39 
 
 		 530 aa  507  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  50.3 
 
 		 531 aa  502  1e-141  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  50.2 
 
 		 531 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  49.9 
 
 		 532 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  50.49 
 
 		 546 aa  491  1e-137  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 		 497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  34.44 
 
 		 524 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  33.04 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 		 530 aa  228  2e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  30.71 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  33.56 
 
 		 548 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  32.33 
 
 		 528 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 		 574 aa  196  1e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  33.25 
 
 		 502 aa  194  5e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 1250 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 398 aa  65.9  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  23.82 
 
 		 459 aa  65.1  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 564 aa  63.9  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.08 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 437 aa  62  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.76 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.76 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  22.85 
 
 		 622 aa  60.5  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.68 
 
 		 681 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  31.61 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  22.26 
 
 		 563 aa  57.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  20.5 
 
 		 518 aa  57.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  24.84 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  24.68 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  21.94 
 
 		 556 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.94 
 
 		 546 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 369 aa  54.3  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 564 aa  54.3  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.62 
 
 		 554 aa  53.9  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 484 aa  53.9  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 369 aa  53.9  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  22.73 
 
 		 372 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  30.65 
 
 		 535 aa  53.5  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  21.79 
 
 		 439 aa  53.5  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  23.73 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_002950  PG1012  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.08 
 
 		 463 aa  51.2  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.589477 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 459 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  22.34 
 
 		 459 aa  50.4  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  33.98 
 
 		 504 aa  50.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.07 
 
 		 430 aa  50.4  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 470 aa  50.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.63 
 
 		 674 aa  50.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  22.96 
 
 		 427 aa  50.4  0.00008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1017  radical SAM domain-containing protein  21.38 
 
 		 510 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.111265  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  24.09 
 
 		 502 aa  50.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  27.92 
 
 		 584 aa  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 435 aa  50.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 460 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  20.58 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 		 610 aa  49.3  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4724  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 		 581 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  24.37 
 
 		 369 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  20.96 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  24.76 
 
 		 455 aa  48.5  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  23.65 
 
 		 557 aa  48.9  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  22.64 
 
 		 369 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  28.67 
 
 		 583 aa  47.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 378 aa  47.8  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 504 aa  47.4  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  27.69 
 
 		 538 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  22.51 
 
 		 600 aa  47.4  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1571  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 505 aa  47  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.805269  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 625 aa  47  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 		 828 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.32 
 
 		 478 aa  47  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  22.15 
 
 		 369 aa  47  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  26 
 
 		 638 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 563 aa  47  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1385  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  21.63 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000358756  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 537 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4163  radical SAM family protein  30.58 
 
 		 524 aa  45.8  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  25.08 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  24.87 
 
 		 537 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  26.29 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0875  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  21.75 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.633872  normal  0.103821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  22.69 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 444 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 562 aa  45.8  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 		 545 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>