36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1388 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 574 aa  1195    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  36.82 
 
 		 524 aa  369  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 		 526 aa  232  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 532 aa  199  9e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 503 aa  197  4.0000000000000005e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 531 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  27.24 
 
 		 515 aa  196  9e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 531 aa  196  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 531 aa  193  5e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 503 aa  193  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 530 aa  192  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 497 aa  183  7e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 528 aa  183  9.000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 548 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 497 aa  178  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  27.26 
 
 		 530 aa  176  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 546 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 393 aa  60.1  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  24.71 
 
 		 398 aa  56.6  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 393 aa  48.9  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 397 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  24.91 
 
 		 397 aa  48.1  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 398 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  40.32 
 
 		 828 aa  47.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  22.44 
 
 		 542 aa  47  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1966  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 		 556 aa  45.4  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000773606  normal  0.460793 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 624 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  25.31 
 
 		 638 aa  44.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  45.45 
 
 		 618 aa  44.3  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1623  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  27.17 
 
 		 452 aa  44.3  0.006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.21 
 
 		 872 aa  44.3  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 405 aa  43.9  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  25.95 
 
 		 472 aa  43.9  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  30.69 
 
 		 470 aa  43.5  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>