116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1667 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 503 aa  1036    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  83.67 
 
 		 503 aa  897    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  54.77 
 
 		 515 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  53.82 
 
 		 546 aa  557  1e-157  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  50.89 
 
 		 531 aa  543  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  51.19 
 
 		 530 aa  539  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  50.59 
 
 		 531 aa  533  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  49.8 
 
 		 532 aa  530  1e-149  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  52.24 
 
 		 531 aa  521  1e-147  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  28.95 
 
 		 526 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 528 aa  200  6e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 		 524 aa  199  7e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 574 aa  193  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 548 aa  192  2e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 		 530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  29.98 
 
 		 502 aa  154  5e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  31.05 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 435 aa  70.1  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 		 393 aa  62.4  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27 
 
 		 1250 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.36 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  23.53 
 
 		 368 aa  58.2  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  29.41 
 
 		 584 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  27.5 
 
 		 610 aa  55.8  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 611 aa  54.7  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  23.69 
 
 		 512 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  23.76 
 
 		 842 aa  54.3  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  26.47 
 
 		 437 aa  54.3  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 398 aa  54.3  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 627 aa  54.3  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  22.51 
 
 		 609 aa  53.5  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  22.34 
 
 		 557 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 537 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  24.66 
 
 		 372 aa  51.2  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.22 
 
 		 449 aa  51.2  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 537 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 		 564 aa  51.2  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  22.3 
 
 		 557 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.35 
 
 		 470 aa  50.4  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 369 aa  50.1  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 600 aa  50.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  29.93 
 
 		 529 aa  50.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 817 aa  50.1  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  25.94 
 
 		 638 aa  49.7  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.1 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 522 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3488  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  19.49 
 
 		 441 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0796  RNA modification protein  26.05 
 
 		 468 aa  48.5  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  27.08 
 
 		 529 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  25.46 
 
 		 842 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  19.49 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 		 441 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 626 aa  47.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 		 622 aa  47.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  22.57 
 
 		 377 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0498  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.03 
 
 		 425 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  21.86 
 
 		 430 aa  47.4  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  22.85 
 
 		 398 aa  47.4  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2210  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.25 
 
 		 434 aa  47.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.277896 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 438 aa  47.4  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  27.08 
 
 		 842 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  26.63 
 
 		 540 aa  47.4  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  22.53 
 
 		 437 aa  47  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0454  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.61 
 
 		 430 aa  47  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000369122  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 360 aa  47  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 812 aa  47  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 529 aa  47  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  24.08 
 
 		 451 aa  47  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 527 aa  47  0.0009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  24.27 
 
 		 444 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.12 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.64 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  23.26 
 
 		 828 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 520 aa  46.2  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 538 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  21.21 
 
 		 864 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.21 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.85 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.51 
 
 		 546 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 826 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 599 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2995  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.17 
 
 		 424 aa  45.4  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.161457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 599 aa  45.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1513  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.84 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.627818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  26.42 
 
 		 836 aa  44.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0345  RNA modification protein  24.9 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1014  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.24 
 
 		 600 aa  44.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1410  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.85 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1849  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.79 
 
 		 439 aa  44.3  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.86 
 
 		 565 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>