123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1317 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  63.43 
 
 		 531 aa  703    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  64.59 
 
 		 530 aa  707    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  64.6 
 
 		 532 aa  719    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 546 aa  1115    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  64 
 
 		 531 aa  716    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  53.82 
 
 		 503 aa  557  1e-157  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  53.23 
 
 		 503 aa  543  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  49.52 
 
 		 515 aa  528  1e-148  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  50.49 
 
 		 531 aa  491  1e-137  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  35.7 
 
 		 497 aa  269  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  31.26 
 
 		 497 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  29.92 
 
 		 530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  30.79 
 
 		 528 aa  196  8.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 526 aa  192  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 548 aa  191  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  30.79 
 
 		 502 aa  182  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 574 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 470 aa  66.6  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24.45 
 
 		 1250 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.32 
 
 		 512 aa  62  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.04 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  24.92 
 
 		 563 aa  57  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  21.16 
 
 		 459 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  24.34 
 
 		 1288 aa  55.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  21.41 
 
 		 557 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.87 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 564 aa  55.5  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  23.15 
 
 		 609 aa  55.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 397 aa  54.3  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  24.57 
 
 		 412 aa  53.9  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  23.18 
 
 		 518 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  23.1 
 
 		 372 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 597 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  22.93 
 
 		 435 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 556 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.39 
 
 		 434 aa  51.2  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  22.79 
 
 		 599 aa  50.8  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  20.77 
 
 		 589 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  19.23 
 
 		 441 aa  50.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  25.58 
 
 		 451 aa  50.4  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  20.55 
 
 		 557 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  25.33 
 
 		 540 aa  50.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  22.37 
 
 		 484 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.57 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 		 405 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  21.43 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  20.65 
 
 		 622 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 537 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.4 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  21.86 
 
 		 599 aa  48.5  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 537 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  22.56 
 
 		 459 aa  48.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  22.12 
 
 		 528 aa  48.1  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  31 
 
 		 504 aa  48.1  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1047  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.24 
 
 		 438 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000312807  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  20.78 
 
 		 723 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 681 aa  48.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  22.38 
 
 		 393 aa  47.8  0.0005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  20.3 
 
 		 625 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 		 600 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1288  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  20.66 
 
 		 431 aa  47.8  0.0005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  22.58 
 
 		 451 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000417118  normal  0.0490217 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 369 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  23.5 
 
 		 434 aa  47.8  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  23.72 
 
 		 828 aa  47.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 369 aa  47.8  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 525 aa  47.4  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 441 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  19.23 
 
 		 441 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 812 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  27.21 
 
 		 502 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0197  radical SAM family protein  23.08 
 
 		 656 aa  47  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1226  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.46 
 
 		 425 aa  47  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.33603  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 360 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  22.43 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.68 
 
 		 408 aa  46.2  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.33 
 
 		 472 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  26.29 
 
 		 842 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2378  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.05 
 
 		 464 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0197332  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2355  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.61 
 
 		 428 aa  45.8  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 842 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1155  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  21.78 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>