123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1955 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  88.14 
 
 		 531 aa  991    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  82.77 
 
 		 530 aa  930    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  85.12 
 
 		 532 aa  966    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  64 
 
 		 546 aa  716    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 531 aa  1085    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  50.89 
 
 		 503 aa  543  1e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  49.52 
 
 		 515 aa  522  1e-147  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  49.7 
 
 		 503 aa  518  1e-146  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  50.3 
 
 		 531 aa  502  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 		 497 aa  254  3e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  30.15 
 
 		 528 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  31.27 
 
 		 497 aa  213  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 530 aa  211  4e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  32.11 
 
 		 548 aa  201  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  30.62 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 574 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  30.74 
 
 		 502 aa  194  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 524 aa  177  5e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 435 aa  66.6  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  24.22 
 
 		 609 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.48 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  23.53 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 556 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  23.18 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  22.97 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  23.67 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 393 aa  55.5  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.24 
 
 		 554 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 371 aa  55.1  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  25.08 
 
 		 377 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 557 aa  53.9  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  24.68 
 
 		 622 aa  53.5  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 557 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 610 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  23.2 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  24.75 
 
 		 410 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  22.39 
 
 		 470 aa  52.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0896  hypothetical protein  26.36 
 
 		 364 aa  52  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 723 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.38 
 
 		 435 aa  51.6  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.26 
 
 		 441 aa  51.6  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.01 
 
 		 674 aa  50.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.29 
 
 		 569 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 412 aa  50.8  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  27.15 
 
 		 584 aa  50.4  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 600 aa  50.4  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  24.78 
 
 		 681 aa  50.4  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  21.91 
 
 		 368 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  22.77 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  24.82 
 
 		 369 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  24.19 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3455  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.86 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.207743  normal  0.273738 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3764  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.86 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.427217  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0796  RNA modification protein  29.47 
 
 		 468 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.74 
 
 		 411 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.54 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1899  radical SAM family protein  31.37 
 
 		 591 aa  48.5  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.54 
 
 		 512 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1014  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.24 
 
 		 600 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 		 438 aa  48.5  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.94 
 
 		 422 aa  48.5  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 611 aa  48.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7154  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.37 
 
 		 479 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535479  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  32.12 
 
 		 569 aa  48.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  23.08 
 
 		 566 aa  48.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2490  radical SAM family protein  27.31 
 
 		 605 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.497518  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  22.52 
 
 		 534 aa  48.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1705  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 589 aa  48.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.871388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3654  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.32 
 
 		 474 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.176133  normal  0.0619947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  21.48 
 
 		 518 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1507  Radical SAM domain protein  25.4 
 
 		 591 aa  47.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 477 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 627 aa  47.8  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 575 aa  47.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  25.46 
 
 		 461 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3548  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.55 
 
 		 535 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.38 
 
 		 580 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  23.6 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3468  radical SAM family protein  32.69 
 
 		 592 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.453671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17011  Fe-S oxidoreductase  23.02 
 
 		 539 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16191  Fe-S oxidoreductase  26.56 
 
 		 544 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 545 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.65 
 
 		 565 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1701  radical SAM family protein  25.9 
 
 		 469 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00126936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  22.25 
 
 		 677 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  26.29 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0741  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 623 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  22.55 
 
 		 366 aa  45.8  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 498 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>