More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1598 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  71.86 
 
 		 474 aa  702    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 477 aa  986    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  68.09 
 
 		 478 aa  663    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  70.3 
 
 		 472 aa  691    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  74.36 
 
 		 472 aa  740    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  73.29 
 
 		 473 aa  711    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  72.44 
 
 		 476 aa  709    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  59.05 
 
 		 471 aa  565  1e-160  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  58.75 
 
 		 470 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  57.45 
 
 		 471 aa  551  1e-156  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  57.76 
 
 		 483 aa  551  1e-155  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  54.96 
 
 		 475 aa  536  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  54.72 
 
 		 480 aa  531  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  56.06 
 
 		 479 aa  525  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  33.1 
 
 		 439 aa  236  7e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  31.39 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  33.25 
 
 		 444 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  31.28 
 
 		 428 aa  210  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  31.28 
 
 		 434 aa  210  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  32.78 
 
 		 444 aa  209  7e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  32.73 
 
 		 446 aa  202  9.999999999999999e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  31.98 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  29.9 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  28.29 
 
 		 448 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  29.97 
 
 		 434 aa  194  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  30.32 
 
 		 449 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  28.35 
 
 		 441 aa  188  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  28.76 
 
 		 428 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  34.6 
 
 		 502 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 462 aa  183  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  30.96 
 
 		 430 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  28.01 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 486 aa  177  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  31.4 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0931  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.25 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.988397  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 509 aa  167  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1516  Radical SAM domain protein  25.82 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0112694  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1318  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.75 
 
 		 471 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  31.16 
 
 		 504 aa  163  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 		 520 aa  162  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  27.44 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 477 aa  159  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  25.06 
 
 		 467 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 		 477 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 468 aa  156  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0940  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.44 
 
 		 461 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.481544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  31.52 
 
 		 500 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 490 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  25.12 
 
 		 469 aa  149  8e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0200  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 		 468 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0997671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 527 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  27.09 
 
 		 490 aa  146  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  29.93 
 
 		 504 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2731  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 465 aa  143  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1806  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0267  Radical SAM domain protein  26.85 
 
 		 469 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0407  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.8 
 
 		 466 aa  140  7e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 512 aa  140  7e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  29.3 
 
 		 503 aa  138  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 504 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0116  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.26 
 
 		 461 aa  137  4e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  24.08 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 523 aa  134  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3556  Radical SAM domain protein  31.23 
 
 		 450 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 502 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0919  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 422 aa  133  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  29.3 
 
 		 503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  26.89 
 
 		 468 aa  130  4.0000000000000003e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 503 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  26.61 
 
 		 471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  28.57 
 
 		 532 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 		 600 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  24.14 
 
 		 529 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  27.64 
 
 		 498 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 445 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 		 525 aa  123  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  24.23 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  23.19 
 
 		 529 aa  120  3.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2757  Radical SAM domain protein  25.84 
 
 		 462 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  24.64 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  25.9 
 
 		 547 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  22.38 
 
 		 522 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  26.69 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 547 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.37 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  24.93 
 
 		 591 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  28.35 
 
 		 444 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 542 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  25.65 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>